RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277198.6

C9orf3-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf3, Length 1,966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-201ENST00000277198 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CHST3Q7LGC8 479 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CMA1P23946 247 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 UBE3CQ15386 1083 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ATP2B3Q16720 1220 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 TIGD1Q96MW7 591 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ZMYND15Q9H091 742 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 GLTPD2A6NH11 291 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ADD2P35612 726 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ANTXR2P58335 489 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 GUCY1B3Q02153 619 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 POTECB2RU33 542 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 NDUFA8P51970 172 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 FOSBP53539 338 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 TPM4P67936 248 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ANO1Q5XXA6 986 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 PSMD1Q99460 953 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ZMYM6O95789 1325 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 PDE8AO60658 829 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 HAND2P61296 217 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 SCARF1Q14162 830 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 METTL24Q5JXM2 366 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 JMYQ8N9B5 988 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 TMEM87BQ96K49 555 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 A0A1B0GVL5 298 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 PPP6R2O75170 966 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 BBOX1O75936 387 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 TUBB4AP04350 444 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 SKILP12757 684 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 KCNJ6P48051 423 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 SLC39A14Q15043 492 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 AOC3Q16853 763 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CLIC4Q9Y696 253 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CTSWP56202 376 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 NLRP12P59046 1061 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ALX1Q15699 326 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 SP8Q8IXZ3 490 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 GREM2Q9H772 168 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CCDC69A6NI79 296 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 IKBKBO14920 756 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ZNF202O95125 648 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 MCAMP43121 646 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CEP135Q66GS9 1140 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 TSC1Q92574 1164 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 FEZ1Q99689 392 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 NEDD4P46934 1319 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 MYO1BO43795 1136 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ITGA6P23229 1130 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 GPSM2P81274 684 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CCZ1BP86790 482 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 PTPN14Q15678 1187 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf3-201ENST00000277198 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
C9orf3-201ENST00000277198 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
C9orf3-201ENST00000277198 PPIP5K2O43314 1243 aa14.89□□□□□ -0.03
C9orf3-201ENST00000277198 NRDCO43847 1150 aa14.89□□□□□ -0.03
C9orf3-201ENST00000277198 PDE8BO95263 885 aa14.89□□□□□ -0.03
C9orf3-201ENST00000277198 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
C9orf3-201ENST00000277198 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
C9orf3-201ENST00000277198 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
C9orf3-201ENST00000277198 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.89□□□□□ -0.03
C9orf3-201ENST00000277198 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms