RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.65■□□□□ 0.9
SRSF1-201ENST00000258962 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.65■□□□□ 0.9
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SRSF1-201ENST00000258962 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
SRSF1-201ENST00000258962 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
SRSF1-201ENST00000258962 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
SRSF1-201ENST00000258962 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
SRSF1-201ENST00000258962 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
SRSF1-201ENST00000258962 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
SRSF1-201ENST00000258962 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.64■□□□□ 0.9
SRSF1-201ENST00000258962 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.64■□□□□ 0.9
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SRSF1-201ENST00000258962 RASSF10A6NK89 507 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 IGSF3O75054 1194 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 TNNI2P48788 182 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 ANKRD1Q15327 319 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 LDHCP07864 332 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 GSTO1P78417 241 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 ST3GAL1Q11201 340 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 RASA3Q14644 834 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 ME3Q16798 604 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 Q6ZUG5 572 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 NAPBQ9H115 298 aa20.63■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 CNTNAP1P78357 1384 aa20.62■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.62■□□□□ 0.89
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SRSF1-201ENST00000258962 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.62■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.61■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 NFKBIBQ15653 356 aa20.61■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.61■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.61■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.61■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 ECE1P42892 770 aa20.6■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 TDO2P48775 406 aa20.6■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.6■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.6■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.6■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 USP40Q9NVE5 1235 aa20.6■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 CEP350Q5VT06 3117 aa20.59■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 VEGFBP49765 207 aa20.59■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 CACNB3P54284 484 aa20.59■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 GRM1Q13255 1194 aa20.59■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 NBR1Q14596 966 aa20.59■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.59■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 NCOA7Q8NI08 942 aa20.59■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.59■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.59■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.59■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 CHST3Q7LGC8 479 aa20.58■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.58■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.58■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 NECAB1Q8N987 351 aa20.58■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.58■□□□□ 0.89
SRSF1-201ENST00000258962 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.58■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 GAKO14976 1311 aa20.58■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 NEDD4P46934 1319 aa20.58■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 ANTXR2P58335 489 aa20.58■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.58■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 PKP1Q13835 747 aa20.58■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 PRKG1Q13976 671 aa20.58■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 FBXL16Q8N461 479 aa20.58■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 BRF1Q92994 677 aa20.58■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 CAPNS2Q96L46 248 aa20.58■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
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SRSF1-201ENST00000258962 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.57■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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SRSF1-201ENST00000258962 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.57■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.56■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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SRSF1-201ENST00000258962 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.56■□□□□ 0.88
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SRSF1-201ENST00000258962 PRC1O43663 620 aa20.56■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 MCM5P33992 734 aa20.56■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 RGMBQ6NW40 437 aa20.56■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 JMYQ8N9B5 988 aa20.56■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 INCENPQ9NQS7 918 aa20.56■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 NUCB2P80303 420 aa20.55■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 PPARAQ07869 468 aa20.55■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.55■□□□□ 0.88
SRSF1-201ENST00000258962 MOB2Q70IA6 237 aa20.55■□□□□ 0.88
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