RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.36■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 WRNIP1Q96S55 665 aa25.36■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 PALD1Q9ULE6 856 aa25.36■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 M0R2C6 588 aa25.35■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 MAP3K9P80192 1104 aa25.35■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 MAP3K10Q02779 954 aa25.35■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 VGLL4Q14135 290 aa25.35■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.35■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.35■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.35■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 DOCK1Q14185 1865 aa25.34■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 UNCXA6NJT0 531 aa25.34■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.34■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 INPP5BP32019 993 aa25.34■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 SREBF2Q12772 1141 aa25.34■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.34■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 ELP3Q9H9T3 547 aa25.34■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.34■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 TBC1D8O95759 1140 aa25.33■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 RGS19P49795 217 aa25.33■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.33■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 SPRYD7Q5W111 196 aa25.33■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 SKAP1Q86WV1 359 aa25.33■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.33■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.32■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 RILPL2Q969X0 211 aa25.32■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 TBC1D12O60347 775 aa25.31■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 GJA5P36382 358 aa25.31■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 TTC22Q5TAA0 569 aa25.31■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.31■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 WNK4Q96J92 1243 aa25.31■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 DNAJC18Q9H819 358 aa25.31■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.31■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 CSADQ9Y600 493 aa25.31■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 GPAA1O43292 621 aa25.3■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 EVX2Q03828 476 aa25.3■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.3■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.29■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.28■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 HLA-DOAP06340 250 aa25.28■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 CYP2D6P10635 497 aa25.28■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 INHBEP58166 350 aa25.28■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 OPTNQ96CV9 577 aa25.28■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 FAM227BQ96M60 508 aa25.28■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 A0A0D9SFI3 127 aa25.27■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 PLCD1P51178 756 aa25.27■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.27■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.27■■□□□ 1.64
COX5B-201ENST00000258424 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.26■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.26■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 GPR25O00155 361 aa25.26■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 ALDH1A1P00352 501 aa25.26■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.26■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 EHD4Q9H223 541 aa25.26■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 MYH8P13535 1937 aa25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 SMIM22K7EJ46 135 aa25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 SDSP20132 328 aa25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 TTC6Q86TZ1 520 aa25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 TICAM2Q86XR7 235 aa25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 OTUD5Q96G74 571 aa25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.24■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.24■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.24■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 FOXP2O15409 715 aa25.23■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 ERO1BQ86YB8 467 aa25.23■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 IFNL1Q8IU54 200 aa25.23■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.23■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 PTPRFP10586 1907 aa25.23■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 USP17L12C9JPN9 530 aa25.22■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 USP17L21D6R901 530 aa25.22■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 GNAT2P19087 354 aa25.22■■□□□ 1.63
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