RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.61■■□□□ 1.21
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DUSP1-201ENST00000239223 SLURP2P0DP57 97 aa22.6■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 SCRN1Q12765 414 aa22.6■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.6■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.6■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.6■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 SBF1O95248 1867 aa22.6■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.6■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.6■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.59■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 ORC4O43929 436 aa22.58■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 NMT2O60551 498 aa22.58■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 EVCP57679 992 aa22.58■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 TCP10Q12799 353 aa22.58■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 ESR2Q92731 530 aa22.58■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.58■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.58■■□□□ 1.21
DUSP1-201ENST00000239223 PFKFB2O60825 505 aa22.58■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 PPFIA3O75145 1194 aa22.58■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 RXRAP19793 462 aa22.58■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.57■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 SIPA1L1O43166 1804 aa22.57■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 JAK2O60674 1132 aa22.57■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM87BQ96K49 555 aa22.57■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 MYL10Q9BUA6 226 aa22.57■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.57■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.56■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 FZD9O00144 591 aa22.56■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 SPDYE6P0CI01 402 aa22.56■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 PDE4BQ07343 736 aa22.56■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.56■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.56■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.56■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 TNKSO95271 1327 aa22.56■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 CLRN2A0PK11 232 aa22.55■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 CTDNEP1O95476 244 aa22.55■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 EGFRP00533 1210 aa22.55■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 GJB2P29033 226 aa22.55■■□□□ 1.2
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DUSP1-201ENST00000239223 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.55■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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DUSP1-201ENST00000239223 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.55■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.55■■□□□ 1.2
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DUSP1-201ENST00000239223 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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DUSP1-201ENST00000239223 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.54■■□□□ 1.2
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DUSP1-201ENST00000239223 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.54■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 MYH8P13535 1937 aa22.54■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 LIFRP42702 1097 aa22.53■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 WTAPQ15007 396 aa22.53■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.53■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.53■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.53■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 MICU3Q86XE3 530 aa22.53■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 IDI2Q9BXS1 227 aa22.53■■□□□ 1.2
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DUSP1-201ENST00000239223 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
DUSP1-201ENST00000239223 TNIP1Q15025 636 aa22.53■■□□□ 1.2
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DUSP1-201ENST00000239223 TSPY2A6NKD2 308 aa22.52■■□□□ 1.2
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DUSP1-201ENST00000239223 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
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DUSP1-201ENST00000239223 LMNB1P20700 586 aa22.51■■□□□ 1.19
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DUSP1-201ENST00000239223 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.5■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 CDC27P30260 824 aa22.5■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.5■■□□□ 1.19
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