RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000094245.3

Cldn3-201, Transcript of Claudin-3, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Cldn3, Length 1,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Tight Junction .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3-201ENSMUST00000094245 B020004C17RikJ3QP07 232 aa22.41■■□□□ 1.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ppm1gQ61074 542 aa22.41■■□□□ 1.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Itgbl1Q8VDV0 494 aa22.41■■□□□ 1.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Igsf9bE9PZ19 1328 aa22.4■■□□□ 1.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Prss40A6H6T1 365 aa22.4■■□□□ 1.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gm8882E9Q7E4 283 aa22.4■■□□□ 1.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fam178bQ24JP3 464 aa22.4■■□□□ 1.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Il17raQ60943 864 aa22.4■■□□□ 1.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Calhm4Q8CE93 315 aa22.4■■□□□ 1.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Prkag2Q91WG5 566 aa22.4■■□□□ 1.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Katnbl1Q9CWJ3 299 aa22.4■■□□□ 1.18
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fam83hQ148V8 1209 aa22.39■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Apbb1ipQ8R5A3 670 aa22.39■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Trex1Q91XB0 314 aa22.39■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rdm1Q9CQK3 281 aa22.39■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Znhit2Q9QY66 399 aa22.39■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa22.38■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 PrkczQ02956 592 aa22.38■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gjc2Q8BQU6 440 aa22.38■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Traf7Q922B6 594 aa22.38■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Phldb3E9QAF4 648 aa22.37■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Igfbp4P47879 254 aa22.37■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Qrich1Q3UA37 777 aa22.37■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Prr7Q3V0I2 269 aa22.37■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Trim27Q62158 513 aa22.37■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Zfp341Q6PGC9 846 aa22.37■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ppp1r11Q8K1L5 131 aa22.37■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Inpp5bQ8K337 993 aa22.37■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fsip1Q9D3V5 435 aa22.37■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Spint1Q9R097 507 aa22.37■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Disp2Q8CIP5 1345 aa22.36■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa22.36■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 DaxxO35613 739 aa22.36■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Nck2O55033 380 aa22.36■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Stac3Q8BZ71 360 aa22.36■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Il7P10168 154 aa22.35■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 GclcP97494 637 aa22.35■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fam228bQ497Q6 232 aa22.35■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Prpf40bQ80W14 870 aa22.35■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Aox3G3X982 1335 aa22.34■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Trim5E9PV98 497 aa22.34■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Magea4F2Z493 315 aa22.34■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Sema3eP70275 775 aa22.34■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 YdjcQ14BV6 310 aa22.34■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Acap3Q6NXL5 833 aa22.34■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Aoc2Q812C9 757 aa22.34■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fam186bD3Z420 943 aa22.33■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Nf2P46662 596 aa22.33■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cyp2c37P56654 490 aa22.33■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 ShbQ6PD21 503 aa22.33■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cyp2c54Q6XVG2 490 aa22.33■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Scfd2Q8BTY8 684 aa22.33■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cyp2c50Q91X77 490 aa22.33■■□□□ 1.17
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Usp31E9Q6Y8 1344 aa22.32■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fzd1O70421 642 aa22.32■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 NpeppsQ11011 920 aa22.32■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fndc3bQ6NWW9 1207 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Bri3bpQ8BXV2 253 aa22.32■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Zbtb9Q8CDC7 459 aa22.32■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Pold4Q9CWP8 107 aa22.32■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa22.32■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa22.32■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa22.32■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Myh7Q91Z83 1935 aa22.31■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Lamb1P02469 1786 aa22.31■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Col2a1P28481 1487 aa22.31■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Znf784Q8BI69 297 aa22.31■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 VrtnQ3SYK4 740 aa22.3■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Brip1Q5SXJ3 1174 aa22.3■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ppp4r3bQ922R5 820 aa22.3■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 HibadhQ99L13 335 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ak7Q9D2H2 614 aa22.3■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa22.29■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Vmn2r68L7N2B3 851 aa22.29■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Bnip3O55003 187 aa22.29■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tmed8Q3UHI4 326 aa22.29■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rgl2Q61193 778 aa22.29■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Znf521Q6KAS7 1311 aa22.29■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa22.28■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Morf4l1P60762 362 aa22.28■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Atg4aQ8C9S8 396 aa22.28■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Cluap1Q8R3P7 413 aa22.28■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Vta1Q9CR26 309 aa22.28■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Dnajb2Q9QYI5 324 aa22.28■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 CrcpO35427 148 aa22.27■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 FanclQ9CR14 375 aa22.27■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 DcpsQ9DAR7 338 aa22.27■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Usp14Q9JMA1 493 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ltbp2O08999 1813 aa22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.2 ms