RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GU69	56 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TTLL3-233	ENST00000602338	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TTLL3-233	ENST00000602338	UQCR11	O14957	56 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TTLL3-233	ENST00000602338	MT4	P47944	62 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TTLL3-233	ENST00000602338	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTLL3-233	ENST00000602338	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.32	□□□□□ -1.72
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.32	□□□□□ -1.72
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.32	□□□□□ -1.72
TTLL3-233	ENST00000602338	MT1G	P13640	62 aa		4.31	□□□□□ -1.72
TTLL3-233	ENST00000602338	MT1M	Q8N339	61 aa		4.29	□□□□□ -1.72
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0D9SG42	100 aa		4.28	□□□□□ -1.72
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TTLL3-233	ENST00000602338	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MT1L	Q93083	61 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GU33	70 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TTLL3-233	ENST00000602338	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TTLL3-233	ENST00000602338	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TTLL3-233	ENST00000602338		K7ERS5	55 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TTLL3-233	ENST00000602338		H3BS24	57 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ROMO1	P60602	79 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TNP1	P09430	55 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TTLL3-233	ENST00000602338	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0A0MQY5	61 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTLL3-233	ENST00000602338	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTLL3-233	ENST00000602338	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTLL3-233	ENST00000602338	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TTLL3-233	ENST00000602338	MT1A	P04731	61 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTLL3-233	ENST00000602338	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TTLL3-233	ENST00000602338	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTLL3-233	ENST00000602338	MT3	P25713	68 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TTLL3-233	ENST00000602338	INE1	O15225	51 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.57	□□□□□ -2
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.5	□□□□□ -2.01
TTLL3-233	ENST00000602338	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.38	□□□□□ -2.03
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.3	□□□□□ -2.04
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.23	□□□□□ -2.05
TTLL3-233	ENST00000602338	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.21	□□□□□ -2.06
TTLL3-233	ENST00000602338	PRM1	P04553	51 aa		2.06	□□□□□ -2.08
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.87	□□□□□ -2.11
TTLL3-233	ENST00000602338	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.51	□□□□□ -2.17

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