RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591971.5

PDE4A-208, Transcript of phosphodiesterase 4A, human

TSL 5

Gene PDE4A, Length 836 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP12-1	P59990	96 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDE4A-208	ENST00000591971	SPRR2E	P22531	72 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDE4A-208	ENST00000591971	SPRR2B	P35325	72 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDE4A-208	ENST00000591971	SPRR2A	P35326	72 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDE4A-208	ENST00000591971	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP10-12	P60413	245 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4A-208	ENST00000591971	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4A-208	ENST00000591971	SPRR2D	P22532	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4A-208	ENST00000591971	TNP1	P09430	55 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4A-208	ENST00000591971	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDE4A-208	ENST00000591971	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PDE4A-208	ENST00000591971	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PDE4A-208	ENST00000591971	ROMO1	P60602	79 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDE4A-208	ENST00000591971	MT1E	P04732	61 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDE4A-208	ENST00000591971	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE4A-208	ENST00000591971	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE4A-208	ENST00000591971	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4A-208	ENST00000591971	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4A-208	ENST00000591971	MT1G	P13640	62 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PDE4A-208	ENST00000591971	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PDE4A-208	ENST00000591971	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PDE4A-208	ENST00000591971	MT1M	Q8N339	61 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PDE4A-208	ENST00000591971	MT1L	Q93083	61 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE4A-208	ENST00000591971	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.32	□□□□□ -1.72
PDE4A-208	ENST00000591971	MT4	P47944	62 aa		4.3	□□□□□ -1.72
PDE4A-208	ENST00000591971	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PDE4A-208	ENST00000591971	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PDE4A-208	ENST00000591971	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PDE4A-208	ENST00000591971	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PDE4A-208	ENST00000591971	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4	□□□□□ -1.77
PDE4A-208	ENST00000591971	MT3	P25713	68 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PDE4A-208	ENST00000591971	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.94	□□□□□ -1.78
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.92	□□□□□ -1.78
PDE4A-208	ENST00000591971	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PDE4A-208	ENST00000591971	MT1A	P04731	61 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PDE4A-208	ENST00000591971	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.62	□□□□□ -1.83
PDE4A-208	ENST00000591971	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PDE4A-208	ENST00000591971	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PDE4A-208	ENST00000591971	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PDE4A-208	ENST00000591971	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PDE4A-208	ENST00000591971	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PDE4A-208	ENST00000591971	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
PDE4A-208	ENST00000591971	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDE4A-208	ENST00000591971	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PDE4A-208	ENST00000591971	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PDE4A-208	ENST00000591971	INE1	O15225	51 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.51	□□□□□ -2.01
PDE4A-208	ENST00000591971	PRM1	P04553	51 aa		2.38	□□□□□ -2.03
PDE4A-208	ENST00000591971	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.36	□□□□□ -2.03
PDE4A-208	ENST00000591971	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PDE4A-208	ENST00000591971	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.79	□□□□□ -2.12
PDE4A-208	ENST00000591971	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.59	□□□□□ -2.16

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