RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543125.5

PGA3-207, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGA3, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.87□□□□□ -1.79
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP12-1P59990 96 aa3.86□□□□□ -1.79
PGA3-207ENST00000543125 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.86□□□□□ -1.79
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP12-2P59991 146 aa3.84□□□□□ -1.79
PGA3-207ENST00000543125 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.83□□□□□ -1.8
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.81□□□□□ -1.8
PGA3-207ENST00000543125 MT1XP80297 61 aa3.8□□□□□ -1.8
PGA3-207ENST00000543125 KMT2DO14686 5537 aa3.78□□□□□ -1.8
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP5-9P26371 169 aa3.76□□□□□ -1.81
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PGA3-207ENST00000543125 LUZP6Q538Z0 58 aa3.74□□□□□ -1.81
PGA3-207ENST00000543125 PP632Q6XCG6 107 aa3.72□□□□□ -1.81
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.72□□□□□ -1.81
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.72□□□□□ -1.81
PGA3-207ENST00000543125 MDN1Q9NU22 5596 aa3.7□□□□□ -1.82
PGA3-207ENST00000543125 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.68□□□□□ -1.82
PGA3-207ENST00000543125 SPRR2EP22531 72 aa3.65□□□□□ -1.83
PGA3-207ENST00000543125 SPRR2BP35325 72 aa3.65□□□□□ -1.83
PGA3-207ENST00000543125 SPRR2AP35326 72 aa3.65□□□□□ -1.83
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.63□□□□□ -1.83
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.63□□□□□ -1.83
PGA3-207ENST00000543125 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.61□□□□□ -1.83
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP10-12P60413 245 aa3.61□□□□□ -1.83
PGA3-207ENST00000543125 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.59□□□□□ -1.83
PGA3-207ENST00000543125 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.55□□□□□ -1.84
PGA3-207ENST00000543125 SPRR2DP22532 72 aa3.53□□□□□ -1.84
PGA3-207ENST00000543125 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.51□□□□□ -1.85
PGA3-207ENST00000543125 TNP1P09430 55 aa3.42□□□□□ -1.86
PGA3-207ENST00000543125 INE1O15225 51 aa3.39□□□□□ -1.87
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.39□□□□□ -1.87
PGA3-207ENST00000543125 MT1EP04732 61 aa3.36□□□□□ -1.87
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.36□□□□□ -1.87
PGA3-207ENST00000543125 LCE3AQ5TA76 89 aa3.34□□□□□ -1.87
PGA3-207ENST00000543125 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PGA3-207ENST00000543125 LCE1EQ5T753 118 aa3.31□□□□□ -1.88
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.31□□□□□ -1.88
PGA3-207ENST00000543125 MT1GP13640 62 aa3.25□□□□□ -1.89
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.24□□□□□ -1.89
PGA3-207ENST00000543125 MT1LQ93083 61 aa3.24□□□□□ -1.89
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP12-3P60328 96 aa3.22□□□□□ -1.89
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.21□□□□□ -1.9
PGA3-207ENST00000543125 MT1MQ8N339 61 aa3.2□□□□□ -1.9
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.15□□□□□ -1.91
PGA3-207ENST00000543125 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.14□□□□□ -1.91
PGA3-207ENST00000543125 MT4P47944 62 aa3.14□□□□□ -1.91
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.14□□□□□ -1.91
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.14□□□□□ -1.91
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.12□□□□□ -1.91
PGA3-207ENST00000543125 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.12□□□□□ -1.91
PGA3-207ENST00000543125 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.98□□□□□ -1.93
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.87□□□□□ -1.95
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP12-4P60329 112 aa2.82□□□□□ -1.96
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.79□□□□□ -1.96
PGA3-207ENST00000543125 MT3P25713 68 aa2.78□□□□□ -1.96
PGA3-207ENST00000543125 MT1AP04731 61 aa2.76□□□□□ -1.97
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.73□□□□□ -1.97
PGA3-207ENST00000543125 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PGA3-207ENST00000543125 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PGA3-207ENST00000543125 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.69□□□□□ -1.98
PGA3-207ENST00000543125 MUC5ACP98088 5654 aa2.67□□□□□ -1.98
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.67□□□□□ -1.98
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP5-8O75690 187 aa2.64□□□□□ -1.99
PGA3-207ENST00000543125 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.59□□□□□ -1.99
PGA3-207ENST00000543125 LCE1FQ5T754 118 aa2.56□□□□□ -2
PGA3-207ENST00000543125 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.26□□□□□ -2.05
PGA3-207ENST00000543125 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.23□□□□□ -2.05
PGA3-207ENST00000543125 PRM1P04553 51 aa2.18□□□□□ -2.06
PGA3-207ENST00000543125 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.15□□□□□ -2.07
PGA3-207ENST00000543125 LCE1CQ5T751 118 aa2.13□□□□□ -2.07
PGA3-207ENST00000543125 PHGR1C9JFL3 82 aa1.92□□□□□ -2.1
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.79□□□□□ -2.12
PGA3-207ENST00000543125 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.77□□□□□ -2.13
PGA3-207ENST00000543125 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.5□□□□□ -2.17
PGA3-207ENST00000543125 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.07□□□□□ -2.24
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