RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CENPFP49454 3210 aa-4.43□□□□□ -3.12
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB133Q30KQ1 61 aa-4.47□□□□□ -3.13
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S100ZQ8WXG8 99 aa-4.47□□□□□ -3.13
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BRCA2P51587 3418 aa-4.48□□□□□ -3.13
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VCANP13611 3396 aa-4.48□□□□□ -3.13
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMIM2Q9BVW6 85 aa-4.49□□□□□ -3.13
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-4.5□□□□□ -3.13
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDH23Q9H251 3354 aa-4.53□□□□□ -3.13
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-4.53□□□□□ -3.14
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PEG3Q9GZU2 1588 aa-4.54□□□□□ -3.14
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-4.56□□□□□ -3.14
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-4.57□□□□□ -3.14
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AGLP35573 1532 aa-4.59□□□□□ -3.14
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HTN1P15515 57 aa-4.64□□□□□ -3.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-4.65□□□□□ -3.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A096LNI7 61 aa-4.65□□□□□ -3.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-4.66□□□□□ -3.16
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLNP26678 52 aa-4.66□□□□□ -3.16
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD52P31358 61 aa-4.66□□□□□ -3.16
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRPM2O94759 1503 aa-4.67□□□□□ -3.16
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-4.67□□□□□ -3.16
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPS13AQ96RL7 3174 aa-4.69□□□□□ -3.16
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNG2P59768 71 aa-4.69□□□□□ -3.16
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-4.69□□□□□ -3.16
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CPS1P31327 1500 aa-4.69□□□□□ -3.16
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TOMM7Q9P0U1 55 aa-4.71□□□□□ -3.16
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLTCL1P53675 1640 aa-4.72□□□□□ -3.16
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-4.73□□□□□ -3.17
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NFAT5O94916 1531 aa-4.74□□□□□ -3.17
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRXQ9BXM0 1461 aa-4.75□□□□□ -3.17
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-4.75□□□□□ -3.17
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDCD5O14737 125 aa-4.83□□□□□ -3.18
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFA1O15239 70 aa-4.83□□□□□ -3.18
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IQGAP1P46940 1657 aa-4.83□□□□□ -3.18
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-4.84□□□□□ -3.18
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB124Q8NES8 71 aa-4.87□□□□□ -3.19
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-4.89□□□□□ -3.19
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADCY10Q96PN6 1610 aa-4.9□□□□□ -3.19
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EFCAB5A4FU69 1503 aa-4.92□□□□□ -3.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A087WWC5 75 aa-5.01□□□□□ -3.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-5.03□□□□□ -3.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-5.07□□□□□ -3.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UTRNP46939 3433 aa-5.09□□□□□ -3.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCC8Q09428 1581 aa-5.09□□□□□ -3.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC01556Q5JQF7 62 aa-5.1□□□□□ -3.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CMC2Q9NRP2 79 aa-5.1□□□□□ -3.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-5.16□□□□□ -3.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMIM5Q71RC9 77 aa-5.16□□□□□ -3.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-5.18□□□□□ -3.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-5.19□□□□□ -3.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-5.23□□□□□ -3.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-5.29□□□□□ -3.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-5.3□□□□□ -3.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP7AQ04656 1500 aa-5.41□□□□□ -3.28
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3BUX3 64 aa-5.43□□□□□ -3.28
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MROH2BQ7Z745 1585 aa-5.54□□□□□ -3.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 APELAP0DMC3 54 aa-5.59□□□□□ -3.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A096LPF7 62 aa-5.65□□□□□ -3.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-5.65□□□□□ -3.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 K7EIM0 57 aa-5.78□□□□□ -3.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-5.81□□□□□ -3.34
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HTN3P15516 51 aa-5.89□□□□□ -3.35
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IQGAP2Q13576 1575 aa-5.9□□□□□ -3.35
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-5.94□□□□□ -3.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRCDQ00LT1 54 aa-5.95□□□□□ -3.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-5.98□□□□□ -3.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-6.03□□□□□ -3.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TOMM5Q8N4H5 51 aa-6.06□□□□□ -3.38
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3BSH0 61 aa-6.34□□□□□ -3.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q9Y3F1 56 aa-6.36□□□□□ -3.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL39P5Q59GN2 51 aa-6.44□□□□□ -3.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-6.46□□□□□ -3.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB108AA8MXU0 73 aa-6.51□□□□□ -3.45
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COX14Q96I36 57 aa-6.64□□□□□ -3.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-6.68□□□□□ -3.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB108BQ8NET1 73 aa-6.89□□□□□ -3.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STATHP02808 62 aa-7.36□□□□□ -3.59
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms