RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WXM4 84 aa-0.05□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 ST20Q9HBF5 79 aa-0.05□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 PSENENQ9NZ42 101 aa-0.06□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 C14orf144Q96I85 54 aa-0.07□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.07□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00158P58513 81 aa-0.08□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-0.08□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 hADV29S1A0JD25 119 aa-0.09□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFC1O43677 76 aa-0.09□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 PRM1P04553 51 aa-0.09□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 COX8AP10176 69 aa-0.09□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 SEC11AP67812 179 aa-0.09□□□□□ -2.42
PTPRC-212ENST00000491302 MPC2O95563 127 aa-0.1□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 VAMP8Q9BV40 100 aa-0.11□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM218A2RU14 115 aa-0.12□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-0.12□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 H0Y9P7 68 aa-0.13□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 H3BUT2 72 aa-0.13□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 H7BZZ5 65 aa-0.13□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 ATOX1O00244 68 aa-0.13□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 COX7BP24311 80 aa-0.13□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 PMCHL1Q16048 86 aa-0.13□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GU69 56 aa-0.14□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-0.14□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 SERP2Q8N6R1 65 aa-0.14□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM13P0DJ93 91 aa-0.15□□□□□ -2.43
PTPRC-212ENST00000491302 TNP1P09430 55 aa-0.16□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 GNGT1P63211 74 aa-0.16□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.16□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-0.16□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 ETDBQ3ZM63 59 aa-0.17□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-0.17□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 HIGD1BQ9P298 99 aa-0.18□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 M0R143 59 aa-0.19□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 LEPROTL1O95214 131 aa-0.19□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 S100A8P05109 93 aa-0.19□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-0.19□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 IGLC3P0DOY3 106 aa-0.2□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-0.2□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GUT8 65 aa-0.21□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 FAUP35544 74 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 PEA15Q15121 130 aa-0.21□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFB1O75438 58 aa-0.22□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 PYY3Q5JQD4 70 aa-0.22□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 SNHG12Q9BXW3 62 aa-0.22□□□□□ -2.44
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf78Q9BR46 151 aa-0.23□□□□□ -2.45
PTPRC-212ENST00000491302 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-0.24□□□□□ -2.45
PTPRC-212ENST00000491302 IGIPA6NJ69 53 aa-0.24□□□□□ -2.45
PTPRC-212ENST00000491302 ACYP1P07311 99 aa-0.24□□□□□ -2.45
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00643Q86TS7 51 aa-0.24□□□□□ -2.45
PTPRC-212ENST00000491302 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.25□□□□□ -2.45
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-0.26□□□□□ -2.45
PTPRC-212ENST00000491302 Q9H521 79 aa-0.26□□□□□ -2.45
PTPRC-212ENST00000491302 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-0.27□□□□□ -2.45
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-0.27□□□□□ -2.45
PTPRC-212ENST00000491302 UMAD1C9J7I0 102 aa-0.29□□□□□ -2.46
PTPRC-212ENST00000491302 ADIRFQ15847 76 aa-0.32□□□□□ -2.46
PTPRC-212ENST00000491302 NREPQ16612 68 aa-0.32□□□□□ -2.46
PTPRC-212ENST00000491302 UBL5Q9BZL1 73 aa-0.34□□□□□ -2.46
PTPRC-212ENST00000491302 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-0.36□□□□□ -2.47
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-0.36□□□□□ -2.47
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-0.37□□□□□ -2.47
PTPRC-212ENST00000491302 C18orf32Q8TCD1 76 aa-0.37□□□□□ -2.47
PTPRC-212ENST00000491302 K7EMI3 77 aa-0.38□□□□□ -2.47
PTPRC-212ENST00000491302 SERF2P84101 59 aa-0.38□□□□□ -2.47
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01549A6NIU2 74 aa-0.42□□□□□ -2.48
PTPRC-212ENST00000491302 ATXN8Q156A1 80 aa-0.42□□□□□ -2.48
PTPRC-212ENST00000491302 TOMM5Q8N4H5 51 aa-0.43□□□□□ -2.48
PTPRC-212ENST00000491302 GNG13Q9P2W3 67 aa-0.43□□□□□ -2.48
PTPRC-212ENST00000491302 S100ZQ8WXG8 99 aa-0.46□□□□□ -2.48
PTPRC-212ENST00000491302 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-0.47□□□□□ -2.48
PTPRC-212ENST00000491302 PLNP26678 52 aa-0.5□□□□□ -2.49
PTPRC-212ENST00000491302 H0YGX0 51 aa-0.54□□□□□ -2.5
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