RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482439.6

TBC1D15-208, Transcript of TBC1 domain family member 15, human

TSL 5

Gene TBC1D15, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.33	□□□□□ -1.56
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPRR2E	P22531	72 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPRR2B	P35325	72 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPRR2A	P35326	72 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	MT1E	P04732	61 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPRR2D	P22532	72 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TBC1D15-208	ENST00000482439	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TBC1D15-208	ENST00000482439	MT1L	Q93083	61 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5	□□□□□ -1.61
TBC1D15-208	ENST00000482439		H3BS24	57 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TBC1D15-208	ENST00000482439	MT1G	P13640	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TBC1D15-208	ENST00000482439	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TBC1D15-208	ENST00000482439	MT1M	Q8N339	61 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TBC1D15-208	ENST00000482439	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TBC1D15-208	ENST00000482439	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TBC1D15-208	ENST00000482439	MT4	P47944	62 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TBC1D15-208	ENST00000482439	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TBC1D15-208	ENST00000482439	MT1A	P04731	61 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TBC1D15-208	ENST00000482439	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TBC1D15-208	ENST00000482439	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TBC1D15-208	ENST00000482439	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TBC1D15-208	ENST00000482439	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4	□□□□□ -1.77
TBC1D15-208	ENST00000482439		A0A0A0MQY5	61 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TBC1D15-208	ENST00000482439	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TBC1D15-208	ENST00000482439	MT3	P25713	68 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TBC1D15-208	ENST00000482439	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TBC1D15-208	ENST00000482439	INE1	O15225	51 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TBC1D15-208	ENST00000482439	PRM1	P04553	51 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TBC1D15-208	ENST00000482439	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TBC1D15-208	ENST00000482439	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TBC1D15-208	ENST00000482439	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.14	□□□□□ -2.07
TBC1D15-208	ENST00000482439	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.62	□□□□□ -2.15

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