RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT3	P25713	68 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TNP1	P09430	55 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4	□□□□□ -1.77
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NEB	P20929	6669 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RUNDC3B-204	ENST00000466676	INE1	O15225	51 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.9	□□□□□ -1.78
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT1B	P07438	61 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KMT2D	O14686	5537 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPRR2E	P22531	72 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPRR2B	P35325	72 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPRR2A	P35326	72 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPRR2D	P22532	72 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT1X	P80297	61 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RUNDC3B-204	ENST00000466676	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.24	□□□□□ -1.89
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT1G	P13640	62 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT1E	P04732	61 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT4	P47944	62 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3	□□□□□ -1.93
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT1M	Q8N339	61 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT1L	Q93083	61 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP12-4	P60329	112 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT1A	P04731	61 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRM1	P04553	51 aa		2.54	□□□□□ -2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		2.48	□□□□□ -2.01
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.45	□□□□□ -2.02
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.45	□□□□□ -2.02
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.43	□□□□□ -2.02
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.13	□□□□□ -2.07
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.81	□□□□□ -2.12
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.77	□□□□□ -2.13
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.67	□□□□□ -2.14
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.12	□□□□□ -2.23

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