RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.27□□□□□ -1.25
LTB-210ENST00000429299 LCE4AQ5TA78 99 aa7.25□□□□□ -1.25
LTB-210ENST00000429299 MT1EP04732 61 aa7.24□□□□□ -1.25
LTB-210ENST00000429299 MT4P47944 62 aa7.23□□□□□ -1.25
LTB-210ENST00000429299 TNP1P09430 55 aa7.21□□□□□ -1.26
LTB-210ENST00000429299 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.2□□□□□ -1.26
LTB-210ENST00000429299 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.2□□□□□ -1.26
LTB-210ENST00000429299 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.19□□□□□ -1.26
LTB-210ENST00000429299 MT1GP13640 62 aa7.1□□□□□ -1.27
LTB-210ENST00000429299 PP632Q6XCG6 107 aa7.05□□□□□ -1.28
LTB-210ENST00000429299 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.05□□□□□ -1.28
LTB-210ENST00000429299 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.02□□□□□ -1.29
LTB-210ENST00000429299 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.99□□□□□ -1.29
LTB-210ENST00000429299 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.99□□□□□ -1.29
LTB-210ENST00000429299 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.97□□□□□ -1.29
LTB-210ENST00000429299 LCE3AQ5TA76 89 aa6.93□□□□□ -1.3
LTB-210ENST00000429299 MT1MQ8N339 61 aa6.93□□□□□ -1.3
LTB-210ENST00000429299 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.92□□□□□ -1.3
LTB-210ENST00000429299 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.89□□□□□ -1.31
LTB-210ENST00000429299 ROMO1P60602 79 aa6.84□□□□□ -1.31
LTB-210ENST00000429299 MT1LQ93083 61 aa6.81□□□□□ -1.32
LTB-210ENST00000429299 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.77□□□□□ -1.33
LTB-210ENST00000429299 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.76□□□□□ -1.33
LTB-210ENST00000429299 KRTAP12-3P60328 96 aa6.72□□□□□ -1.33
LTB-210ENST00000429299 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.71□□□□□ -1.34
LTB-210ENST00000429299 BRK1Q8WUW1 75 aa6.71□□□□□ -1.34
LTB-210ENST00000429299 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.63□□□□□ -1.35
LTB-210ENST00000429299 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.46□□□□□ -1.38
LTB-210ENST00000429299 KRTAP12-4P60329 112 aa6.45□□□□□ -1.38
LTB-210ENST00000429299 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.43□□□□□ -1.38
LTB-210ENST00000429299 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.42□□□□□ -1.38
LTB-210ENST00000429299 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
LTB-210ENST00000429299 PMAIP1Q13794 54 aa6.36□□□□□ -1.39
LTB-210ENST00000429299 PRO0628Q9UI54 55 aa6.32□□□□□ -1.4
LTB-210ENST00000429299 SVIPQ8NHG7 77 aa6.24□□□□□ -1.41
LTB-210ENST00000429299 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.23□□□□□ -1.41
LTB-210ENST00000429299 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.22□□□□□ -1.41
LTB-210ENST00000429299 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
LTB-210ENST00000429299 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
LTB-210ENST00000429299 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.12□□□□□ -1.43
LTB-210ENST00000429299 MUC5ACP98088 5654 aa6.1□□□□□ -1.43
LTB-210ENST00000429299 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
LTB-210ENST00000429299 KRTAP5-8O75690 187 aa6.02□□□□□ -1.45
LTB-210ENST00000429299 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.01□□□□□ -1.45
LTB-210ENST00000429299 PRAC1Q96KF2 57 aa5.94□□□□□ -1.46
LTB-210ENST00000429299 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.86□□□□□ -1.47
LTB-210ENST00000429299 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.84□□□□□ -1.47
LTB-210ENST00000429299 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.82□□□□□ -1.48
LTB-210ENST00000429299 MT1AP04731 61 aa5.78□□□□□ -1.48
LTB-210ENST00000429299 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.78□□□□□ -1.48
LTB-210ENST00000429299 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.76□□□□□ -1.49
LTB-210ENST00000429299 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.68□□□□□ -1.5
LTB-210ENST00000429299 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.66□□□□□ -1.5
LTB-210ENST00000429299 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.51□□□□□ -1.53
LTB-210ENST00000429299 MT3P25713 68 aa5.35□□□□□ -1.55
LTB-210ENST00000429299 LUZP6Q538Z0 58 aa5.12□□□□□ -1.59
LTB-210ENST00000429299 LCE1EQ5T753 118 aa5.08□□□□□ -1.6
LTB-210ENST00000429299 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.82□□□□□ -1.64
LTB-210ENST00000429299 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.79□□□□□ -1.64
LTB-210ENST00000429299 LCE1CQ5T751 118 aa4.71□□□□□ -1.66
LTB-210ENST00000429299 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.59□□□□□ -1.67
LTB-210ENST00000429299 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.59□□□□□ -1.67
LTB-210ENST00000429299 NDUFAF8A1L188 74 aa4.55□□□□□ -1.68
LTB-210ENST00000429299 H3BS24 57 aa4.39□□□□□ -1.71
LTB-210ENST00000429299 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.39□□□□□ -1.71
LTB-210ENST00000429299 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.39□□□□□ -1.71
LTB-210ENST00000429299 LCE1FQ5T754 118 aa4.37□□□□□ -1.71
LTB-210ENST00000429299 A0A0A0MQY5 61 aa4.24□□□□□ -1.73
LTB-210ENST00000429299 PHGR1C9JFL3 82 aa4.22□□□□□ -1.73
LTB-210ENST00000429299 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
LTB-210ENST00000429299 INE1O15225 51 aa3.89□□□□□ -1.79
LTB-210ENST00000429299 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.83□□□□□ -1.8
LTB-210ENST00000429299 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.6□□□□□ -1.83
LTB-210ENST00000429299 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.58□□□□□ -1.84
LTB-210ENST00000429299 PRM1P04553 51 aa3.48□□□□□ -1.85
LTB-210ENST00000429299 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.23□□□□□ -1.89
LTB-210ENST00000429299 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.47□□□□□ -2.01
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