RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP5-9P26371 169 aa4.16□□□□□ -1.74
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POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.1□□□□□ -1.75
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.1□□□□□ -1.75
POLR1A-204ENST00000424089 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.1□□□□□ -1.75
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POLR1A-204ENST00000424089 MT1XP80297 61 aa4.07□□□□□ -1.76
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.07□□□□□ -1.76
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POLR1A-204ENST00000424089 SPRR2DP22532 72 aa3.94□□□□□ -1.78
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POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.41□□□□□ -1.86
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.35□□□□□ -1.87
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POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.21□□□□□ -1.9
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POLR1A-204ENST00000424089 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.72□□□□□ -1.97
POLR1A-204ENST00000424089 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.71□□□□□ -1.98
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.68□□□□□ -1.98
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.67□□□□□ -1.98
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POLR1A-204ENST00000424089 PHGR1C9JFL3 82 aa2.12□□□□□ -2.07
POLR1A-204ENST00000424089 LCE1FQ5T754 118 aa2.04□□□□□ -2.08
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.93□□□□□ -2.1
POLR1A-204ENST00000424089 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.68□□□□□ -2.14
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.61□□□□□ -2.15
POLR1A-204ENST00000424089 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.15□□□□□ -2.23
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