RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365223.1

SNORD58C-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 58C, humanhuman

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Gene SNORD58C, Length 64 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD58C-201ENST00000365223 SMIM2Q9BVW6 85 aa-6.38□□□□□ -3.43
SNORD58C-201ENST00000365223 CDH23Q9H251 3354 aa-6.4□□□□□ -3.43
SNORD58C-201ENST00000365223 CD52P31358 61 aa-6.41□□□□□ -3.44
SNORD58C-201ENST00000365223 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-6.41□□□□□ -3.44
SNORD58C-201ENST00000365223 H0YGX0 51 aa-6.42□□□□□ -3.44
SNORD58C-201ENST00000365223 ABCA8O94911 1581 aa-6.43□□□□□ -3.44
SNORD58C-201ENST00000365223 TFF3Q07654 80 aa-6.44□□□□□ -3.44
SNORD58C-201ENST00000365223 ABCA6Q8N139 1617 aa-6.48□□□□□ -3.45
SNORD58C-201ENST00000365223 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-6.51□□□□□ -3.45
SNORD58C-201ENST00000365223 HTN1P15515 57 aa-6.52□□□□□ -3.45
SNORD58C-201ENST00000365223 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-6.52□□□□□ -3.45
SNORD58C-201ENST00000365223 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-6.53□□□□□ -3.45
SNORD58C-201ENST00000365223 AGLP35573 1532 aa-6.57□□□□□ -3.46
SNORD58C-201ENST00000365223 PEG3Q9GZU2 1588 aa-6.62□□□□□ -3.47
SNORD58C-201ENST00000365223 A0A096LNI7 61 aa-6.63□□□□□ -3.47
SNORD58C-201ENST00000365223 VPS13AQ96RL7 3174 aa-6.63□□□□□ -3.47
SNORD58C-201ENST00000365223 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-6.65□□□□□ -3.47
SNORD58C-201ENST00000365223 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-6.67□□□□□ -3.48
SNORD58C-201ENST00000365223 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-6.69□□□□□ -3.48
SNORD58C-201ENST00000365223 TRPM2O94759 1503 aa-6.73□□□□□ -3.49
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SNORD58C-201ENST00000365223 TOMM7Q9P0U1 55 aa-6.74□□□□□ -3.49
SNORD58C-201ENST00000365223 CLTCL1P53675 1640 aa-6.75□□□□□ -3.49
SNORD58C-201ENST00000365223 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-6.83□□□□□ -3.5
SNORD58C-201ENST00000365223 CPS1P31327 1500 aa-6.89□□□□□ -3.51
SNORD58C-201ENST00000365223 PRXQ9BXM0 1461 aa-6.9□□□□□ -3.51
SNORD58C-201ENST00000365223 DEFB124Q8NES8 71 aa-6.9□□□□□ -3.51
SNORD58C-201ENST00000365223 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-6.9□□□□□ -3.51
SNORD58C-201ENST00000365223 PDCD5O14737 125 aa-6.93□□□□□ -3.52
SNORD58C-201ENST00000365223 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-6.94□□□□□ -3.52
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SNORD58C-201ENST00000365223 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-7.25□□□□□ -3.57
SNORD58C-201ENST00000365223 EFCAB5A4FU69 1503 aa-7.27□□□□□ -3.57
SNORD58C-201ENST00000365223 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-7.41□□□□□ -3.6
SNORD58C-201ENST00000365223 A0A087WWC5 75 aa-7.42□□□□□ -3.6
SNORD58C-201ENST00000365223 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-7.42□□□□□ -3.6
SNORD58C-201ENST00000365223 CMC2Q9NRP2 79 aa-7.43□□□□□ -3.6
SNORD58C-201ENST00000365223 ABCC8Q09428 1581 aa-7.43□□□□□ -3.6
SNORD58C-201ENST00000365223 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-7.43□□□□□ -3.6
SNORD58C-201ENST00000365223 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-7.44□□□□□ -3.6
SNORD58C-201ENST00000365223 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-7.49□□□□□ -3.61
SNORD58C-201ENST00000365223 SMIM5Q71RC9 77 aa-7.52□□□□□ -3.61
SNORD58C-201ENST00000365223 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-7.54□□□□□ -3.62
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SNORD58C-201ENST00000365223 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-7.7□□□□□ -3.64
SNORD58C-201ENST00000365223 ATP7AQ04656 1500 aa-7.71□□□□□ -3.64
SNORD58C-201ENST00000365223 MROH2BQ7Z745 1585 aa-7.9□□□□□ -3.67
SNORD58C-201ENST00000365223 APELAP0DMC3 54 aa-7.92□□□□□ -3.68
SNORD58C-201ENST00000365223 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-7.95□□□□□ -3.68
SNORD58C-201ENST00000365223 A0A096LPF7 62 aa-8.01□□□□□ -3.69
SNORD58C-201ENST00000365223 K7EIM0 57 aa-8.26□□□□□ -3.73
SNORD58C-201ENST00000365223 HTN3P15516 51 aa-8.27□□□□□ -3.73
SNORD58C-201ENST00000365223 PRCDQ00LT1 54 aa-8.41□□□□□ -3.76
SNORD58C-201ENST00000365223 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-8.52□□□□□ -3.77
SNORD58C-201ENST00000365223 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-8.52□□□□□ -3.77
SNORD58C-201ENST00000365223 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-8.52□□□□□ -3.77
SNORD58C-201ENST00000365223 IQGAP2Q13576 1575 aa-8.57□□□□□ -3.78
SNORD58C-201ENST00000365223 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-8.81□□□□□ -3.82
SNORD58C-201ENST00000365223 TOMM5Q8N4H5 51 aa-8.81□□□□□ -3.82
SNORD58C-201ENST00000365223 Q9Y3F1 56 aa-8.81□□□□□ -3.82
SNORD58C-201ENST00000365223 H3BSH0 61 aa-8.87□□□□□ -3.83
SNORD58C-201ENST00000365223 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-9.2□□□□□ -3.88
SNORD58C-201ENST00000365223 RPL39P5Q59GN2 51 aa-9.22□□□□□ -3.89
SNORD58C-201ENST00000365223 COX14Q96I36 57 aa-9.26□□□□□ -3.89
SNORD58C-201ENST00000365223 DEFB108AA8MXU0 73 aa-9.31□□□□□ -3.9
SNORD58C-201ENST00000365223 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-9.55□□□□□ -3.94
SNORD58C-201ENST00000365223 DEFB108BQ8NET1 73 aa-9.75□□□□□ -3.97
SNORD58C-201ENST00000365223 STATHP02808 62 aa-10.25□□□□□ -4.05
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