RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 FAT1Q14517 4588 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP10-12P60413 245 aa9□□□□□ -0.97
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9□□□□□ -0.97
PTPRJ-208ENST00000615445 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRJ-208ENST00000615445 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRJ-208ENST00000615445 RYR1P21817 5038 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.8□□□□□ -1
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAH2Q9P225 4427 aa8.8□□□□□ -1
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP12-3P60328 96 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRJ-208ENST00000615445 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE3AQ5TA76 89 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 KMT2AQ03164 3969 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 ANK2Q01484 3957 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRJ-208ENST00000615445 MT1HP80294 61 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRJ-208ENST00000615445 LYSTQ99698 3801 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRJ-208ENST00000615445 MYCBP2O75592 4640 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRJ-208ENST00000615445 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRJ-208ENST00000615445 RYR3Q15413 4870 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-208ENST00000615445 MT2AP02795 61 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRJ-208ENST00000615445 INE1O15225 51 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRJ-208ENST00000615445 MT1FP04733 61 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 RYR2Q92736 4967 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRJ-208ENST00000615445 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRJ-208ENST00000615445 HERC2O95714 4834 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRJ-208ENST00000615445 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8□□□□□ -1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 LRP2P98164 4655 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP10-5P60370 271 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 PKHD1P08F94 4074 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 HSPG2P98160 4391 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRJ-208ENST00000615445 PKD1P98161 4303 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE2CQ5TA81 110 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRJ-208ENST00000615445 MT1XP80297 61 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRJ-208ENST00000615445 MT1BP07438 61 aa7.65□□□□□ -1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 HERC1Q15751 4861 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 LPAP08519 4548 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRJ-208ENST00000615445 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRJ-208ENST00000615445 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRJ-208ENST00000615445 MUC17Q685J3 4493 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRJ-208ENST00000615445 TNXBP22105 4242 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRR2EP22531 72 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRR2BP35325 72 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRR2AP35326 72 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE2BO14633 110 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 MT1GP13640 62 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRJ-208ENST00000615445 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRJ-208ENST00000615445 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRJ-208ENST00000615445 LCE3BQ5TA77 95 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRJ-208ENST00000615445 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.02□□□□□ -1.28
PTPRJ-208ENST00000615445 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRR2DP22532 72 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF213Q63HN8 5207 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 MT1LQ93083 61 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 MT1EP04732 61 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP12-4P60329 112 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms