RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615438.4

PKIB-211, Transcript of cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKIB, Length 1,936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIB-211ENST00000615438 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.28□□□□□ -1.88
PKIB-211ENST00000615438 A0A1B0GVY2 172 aa3.28□□□□□ -1.88
PKIB-211ENST00000615438 CFAP46Q8IYW2 2715 aa3.28□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 LRRK2Q5S007 2527 aa3.26□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 MYCBP2O75592 4640 aa3.26□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 C9orf92A6NGG3 77 aa3.25□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.25□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 ITPR3Q14573 2671 aa3.25□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 FBN2P35556 2912 aa3.25□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.24□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 ACANP16112 2415 aa3.23□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 USP24Q9UPU5 2620 aa3.22□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.22□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.22□□□□□ -1.89
PKIB-211ENST00000615438 SMR3AQ99954 134 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-211ENST00000615438 LYSTQ99698 3801 aa3.18□□□□□ -1.9
PKIB-211ENST00000615438 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PKIB-211ENST00000615438 FBN3Q75N90 2809 aa3.17□□□□□ -1.9
PKIB-211ENST00000615438 ZANQ9Y493 2812 aa3.17□□□□□ -1.9
PKIB-211ENST00000615438 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.17□□□□□ -1.9
PKIB-211ENST00000615438 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PKIB-211ENST00000615438 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.14□□□□□ -1.91
PKIB-211ENST00000615438 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.14□□□□□ -1.91
PKIB-211ENST00000615438 ITPR2Q14571 2701 aa3.13□□□□□ -1.91
PKIB-211ENST00000615438 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.12□□□□□ -1.91
PKIB-211ENST00000615438 ATRQ13535 2644 aa3.11□□□□□ -1.91
PKIB-211ENST00000615438 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.1□□□□□ -1.91
PKIB-211ENST00000615438 TNP1P09430 55 aa3.1□□□□□ -1.91
PKIB-211ENST00000615438 MYO18BQ8IUG5 2567 aa3.1□□□□□ -1.91
PKIB-211ENST00000615438 MAST4O15021 2626 aa3.09□□□□□ -1.91
PKIB-211ENST00000615438 TENM3Q9P273 2699 aa3.09□□□□□ -1.91
PKIB-211ENST00000615438 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.09□□□□□ -1.92
PKIB-211ENST00000615438 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP10-10P60014 251 aa3.08□□□□□ -1.92
PKIB-211ENST00000615438 KMT2AQ03164 3969 aa3.08□□□□□ -1.92
PKIB-211ENST00000615438 NOTCH2Q04721 2471 aa3.07□□□□□ -1.92
PKIB-211ENST00000615438 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PKIB-211ENST00000615438 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.06□□□□□ -1.92
PKIB-211ENST00000615438 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.04□□□□□ -1.92
PKIB-211ENST00000615438 POLQO75417 2590 aa3.03□□□□□ -1.92
PKIB-211ENST00000615438 NOTCH1P46531 2555 aa3.03□□□□□ -1.92
PKIB-211ENST00000615438 DNAH2Q9P225 4427 aa3.02□□□□□ -1.93
PKIB-211ENST00000615438 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PKIB-211ENST00000615438 FLNCQ14315 2725 aa3□□□□□ -1.93
PKIB-211ENST00000615438 J3QKU1 62 aa2.98□□□□□ -1.93
PKIB-211ENST00000615438 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.97□□□□□ -1.93
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.97□□□□□ -1.93
PKIB-211ENST00000615438 APOBP04114 4563 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PKIB-211ENST00000615438 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP10-5P60370 271 aa2.95□□□□□ -1.94
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.93□□□□□ -1.94
PKIB-211ENST00000615438 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.93□□□□□ -1.94
PKIB-211ENST00000615438 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.92□□□□□ -1.94
PKIB-211ENST00000615438 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.88□□□□□ -1.95
PKIB-211ENST00000615438 SACSQ9NZJ4 4579 aa2.88□□□□□ -1.95
PKIB-211ENST00000615438 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PKIB-211ENST00000615438 MT3P25713 68 aa2.87□□□□□ -1.95
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP10-1P60331 282 aa2.87□□□□□ -1.95
PKIB-211ENST00000615438 STAB1Q9NY15 2570 aa2.87□□□□□ -1.95
PKIB-211ENST00000615438 MGAM2Q2M2H8 2515 aa2.87□□□□□ -1.95
PKIB-211ENST00000615438 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.86□□□□□ -1.95
PKIB-211ENST00000615438 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PKIB-211ENST00000615438 PKD1P98161 4303 aa2.82□□□□□ -1.96
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP10-12P60413 245 aa2.82□□□□□ -1.96
PKIB-211ENST00000615438 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.81□□□□□ -1.96
PKIB-211ENST00000615438 LCE3AQ5TA76 89 aa2.81□□□□□ -1.96
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa2.8□□□□□ -1.96
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.79□□□□□ -1.96
PKIB-211ENST00000615438 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.79□□□□□ -1.96
PKIB-211ENST00000615438 DNHD1Q96M86 4753 aa2.78□□□□□ -1.96
PKIB-211ENST00000615438 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.76□□□□□ -1.97
PKIB-211ENST00000615438 PKHD1P08F94 4074 aa2.75□□□□□ -1.97
PKIB-211ENST00000615438 LRP1BQ9NZR2 4599 aa2.74□□□□□ -1.97
PKIB-211ENST00000615438 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.74□□□□□ -1.97
PKIB-211ENST00000615438 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.74□□□□□ -1.97
PKIB-211ENST00000615438 TNXBP22105 4242 aa2.73□□□□□ -1.97
PKIB-211ENST00000615438 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.72□□□□□ -1.97
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.72□□□□□ -1.97
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.72□□□□□ -1.97
PKIB-211ENST00000615438 DNAH5Q8TE73 4624 aa2.7□□□□□ -1.98
PKIB-211ENST00000615438 HSPG2P98160 4391 aa2.69□□□□□ -1.98
PKIB-211ENST00000615438 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP12-3P60328 96 aa2.66□□□□□ -1.98
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.64□□□□□ -1.99
PKIB-211ENST00000615438 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PKIB-211ENST00000615438 M0R2T5 61 aa2.62□□□□□ -1.99
PKIB-211ENST00000615438 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP12-4P60329 112 aa2.54□□□□□ -2
PKIB-211ENST00000615438 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.54□□□□□ -2
PKIB-211ENST00000615438 KRTAP5-8O75690 187 aa2.53□□□□□ -2
PKIB-211ENST00000615438 FAT1Q14517 4588 aa2.51□□□□□ -2.01
PKIB-211ENST00000615438 LCE1FQ5T754 118 aa2.46□□□□□ -2.02
PKIB-211ENST00000615438 LPAP08519 4548 aa2.46□□□□□ -2.02
PKIB-211ENST00000615438 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
PKIB-211ENST00000615438 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms