RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-212ENST00000580838 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 Q6ZSA8 131 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 LY6G6CO95867 125 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 DNAH2Q9P225 4427 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 A0A0A0MQY5 61 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-212ENST00000580838 FBN3Q75N90 2809 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-212ENST00000580838 TGP01266 2768 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP10-1P60331 282 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-212ENST00000580838 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-212ENST00000580838 LCE3AQ5TA76 89 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRM-212ENST00000580838 A8MUU9 505 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRM-212ENST00000580838 LINC01554Q52M75 96 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRM-212ENST00000580838 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRM-212ENST00000580838 K7ERS5 55 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-212ENST00000580838 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-212ENST00000580838 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-212ENST00000580838 PRAC1Q96KF2 57 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-212ENST00000580838 A0A1B0GU33 70 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-212ENST00000580838 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-212ENST00000580838 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-212ENST00000580838 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-212ENST00000580838 KMT2AQ03164 3969 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-212ENST00000580838 PKD1P98161 4303 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-212ENST00000580838 CSAG1Q6PB30 78 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-212ENST00000580838 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-212ENST00000580838 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRM-212ENST00000580838 H0YAA0 97 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRM-212ENST00000580838 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRM-212ENST00000580838 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP10-8P60410 259 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-212ENST00000580838 C9orf92A6NGG3 77 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-212ENST00000580838 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-212ENST00000580838 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP12-2P59991 146 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-212ENST00000580838 ROMO1P60602 79 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-212ENST00000580838 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-212ENST00000580838 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-212ENST00000580838 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-212ENST00000580838 S4R3F8 94 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-212ENST00000580838 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-212ENST00000580838 APOBP04114 4563 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRM-212ENST00000580838 PKHD1P08F94 4074 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-212ENST00000580838 DNHD1Q96M86 4753 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-212ENST00000580838 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-212ENST00000580838 M0QZ58 72 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-212ENST00000580838 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-212ENST00000580838 CRIPTQ9P021 101 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-212ENST00000580838 Q5VSD8 79 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 TNXBP22105 4242 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 A0A0D9SG42 100 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 FAT1Q14517 4588 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 HSPG2P98160 4391 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 NDUFAF8A1L188 74 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 TPRXLQ17RH7 258 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 P0C880 135 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-212ENST00000580838 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP12-1P59990 96 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-212ENST00000580838 MT1HL1P0DM35 61 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-212ENST00000580838 LCE1CQ5T751 118 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-212ENST00000580838 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-212ENST00000580838 RYR2Q92736 4967 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRM-212ENST00000580838 R4GN34 69 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRM-212ENST00000580838 MYCBP2O75592 4640 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRM-212ENST00000580838 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-212ENST00000580838 PP632Q6XCG6 107 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-212ENST00000580838 RYR1P21817 5038 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP5-8O75690 187 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-212ENST00000580838 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-212ENST00000580838 PLAC4Q8WY50 150 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-212ENST00000580838 LUZP6Q538Z0 58 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-212ENST00000580838 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-212ENST00000580838 RYR3Q15413 4870 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-212ENST00000580838 TNP1P09430 55 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-212ENST00000580838 LRP2P98164 4655 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-212ENST00000580838 MUC17Q685J3 4493 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-212ENST00000580838 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-212ENST00000580838 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.53□□□□□ -2
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