RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572433.5

ITGAE-208, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 731 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-208ENST00000572433 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.06□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 MUC2Q02817 5179 aa3.06□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 LINC01549A6NIU2 74 aa3.05□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 LPAP08519 4548 aa3.05□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 F8VRH5 84 aa3.04□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 C2orf82Q6UX34 121 aa3.04□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.04□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 COA5Q86WW8 74 aa3.04□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 Q8IZM0 81 aa3.04□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.04□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 C22orf24Q9Y442 160 aa3.04□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.03□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.03□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.03□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 Q5VV11 94 aa3.03□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 C20orf197Q8N268 126 aa3.03□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.03□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.03□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.02□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.02□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.01□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 F8WEM9 126 aa3.01□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.01□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.01□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 AMELXQ99217 191 aa3.01□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.01□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 IGIPA6NJ69 53 aa3□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 SFTA2Q6UW10 78 aa3□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 COX7B2Q8TF08 81 aa3□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 LIMD2Q9BT23 127 aa3□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.99□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 HCG22E2RYF7 251 aa2.99□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.99□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 COX17Q14061 63 aa2.98□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.98□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.97□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 COX6CP09669 75 aa2.97□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 PLNP26678 52 aa2.97□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 ROMO1P60602 79 aa2.97□□□□□ -1.93
ITGAE-208ENST00000572433 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.96□□□□□ -1.94
ITGAE-208ENST00000572433 A0A087WSZ3 146 aa2.95□□□□□ -1.94
ITGAE-208ENST00000572433 LINC00158P58513 81 aa2.95□□□□□ -1.94
ITGAE-208ENST00000572433 PRLHP81277 87 aa2.94□□□□□ -1.94
ITGAE-208ENST00000572433 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa2.93□□□□□ -1.94
ITGAE-208ENST00000572433 SPINK1P00995 79 aa2.93□□□□□ -1.94
ITGAE-208ENST00000572433 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
ITGAE-208ENST00000572433 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.92□□□□□ -1.94
ITGAE-208ENST00000572433 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.92□□□□□ -1.94
ITGAE-208ENST00000572433 A0A087WVE0 104 aa2.91□□□□□ -1.94
ITGAE-208ENST00000572433 ZNF815PA8K554 130 aa2.91□□□□□ -1.94
ITGAE-208ENST00000572433 CASC2Q6XLA1 102 aa2.9□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 SPRR4Q96PI1 79 aa2.9□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 LINC00846Q9NV44 126 aa2.9□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.89□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.88□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.88□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 NCR3O14931 201 aa2.88□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.88□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.88□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.88□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 SNURFQ9Y675 71 aa2.87□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.86□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 DNAL4O96015 105 aa2.86□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 SPRR1AP35321 89 aa2.85□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 Q6ZQT0 140 aa2.85□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 Q6ZRX8 168 aa2.84□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 MUSTN1Q8IVN3 82 aa2.84□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.84□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.84□□□□□ -1.95
ITGAE-208ENST00000572433 NREPQ16612 68 aa2.83□□□□□ -1.96
ITGAE-208ENST00000572433 MUC17Q685J3 4493 aa2.83□□□□□ -1.96
ITGAE-208ENST00000572433 NDUFB1O75438 58 aa2.81□□□□□ -1.96
ITGAE-208ENST00000572433 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.81□□□□□ -1.96
ITGAE-208ENST00000572433 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2.79□□□□□ -1.96
ITGAE-208ENST00000572433 PDE6GP18545 87 aa2.79□□□□□ -1.96
ITGAE-208ENST00000572433 PRR15LQ9BU68 103 aa2.79□□□□□ -1.96
ITGAE-208ENST00000572433 UBL5Q9BZL1 73 aa2.79□□□□□ -1.96
ITGAE-208ENST00000572433 M0R2T5 61 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGAE-208ENST00000572433 COX7BP24311 80 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGAE-208ENST00000572433 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGAE-208ENST00000572433 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGAE-208ENST00000572433 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGAE-208ENST00000572433 C9orf92A6NGG3 77 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGAE-208ENST00000572433 SPRR1BP22528 89 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGAE-208ENST00000572433 CSAG1Q6PB30 78 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGAE-208ENST00000572433 LINC00308Q8TCZ7 52 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGAE-208ENST00000572433 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGAE-208ENST00000572433 H0YGX0 51 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGAE-208ENST00000572433 LINC00208Q96KT6 92 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGAE-208ENST00000572433 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.74□□□□□ -1.97
ITGAE-208ENST00000572433 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.74□□□□□ -1.97
ITGAE-208ENST00000572433 DMAC1Q96GE9 116 aa2.73□□□□□ -1.97
ITGAE-208ENST00000572433 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.71□□□□□ -1.98
ITGAE-208ENST00000572433 SPINK7P58062 85 aa2.71□□□□□ -1.98
ITGAE-208ENST00000572433 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
ITGAE-208ENST00000572433 MT1HP80294 61 aa2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms