RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522466.1

PDGFRB-210, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 296 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-210ENST00000522466 FXYD2P54710 66 aa3.35□□□□□ -1.87
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PDGFRB-210ENST00000522466 MT1XP80297 61 aa3.35□□□□□ -1.87
PDGFRB-210ENST00000522466 hDV103S1A0JD37 113 aa3.34□□□□□ -1.87
PDGFRB-210ENST00000522466 PYY3Q5JQD4 70 aa3.34□□□□□ -1.87
PDGFRB-210ENST00000522466 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.34□□□□□ -1.87
PDGFRB-210ENST00000522466 J3QR89 54 aa3.33□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 K7EQZ3 153 aa3.33□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.33□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.33□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 K7ERJ3 54 aa3.32□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.32□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 HIGD1BQ9P298 99 aa3.32□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 COX6CP09669 75 aa3.3□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 CRIPTQ9P021 101 aa3.3□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.3□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 HCG22E2RYF7 251 aa3.29□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.29□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP12-2P59991 146 aa3.29□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.29□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 VAMP8Q9BV40 100 aa3.29□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.29□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 NREPQ16612 68 aa3.28□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 SPATA45Q537H7 98 aa3.28□□□□□ -1.88
PDGFRB-210ENST00000522466 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.27□□□□□ -1.89
PDGFRB-210ENST00000522466 A0A087WVE0 104 aa3.25□□□□□ -1.89
PDGFRB-210ENST00000522466 PLAC4Q8WY50 150 aa3.25□□□□□ -1.89
PDGFRB-210ENST00000522466 A8MUN3 132 aa3.24□□□□□ -1.89
PDGFRB-210ENST00000522466 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.24□□□□□ -1.89
PDGFRB-210ENST00000522466 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.23□□□□□ -1.89
PDGFRB-210ENST00000522466 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.22□□□□□ -1.89
PDGFRB-210ENST00000522466 CASC2Q6XLA1 102 aa3.22□□□□□ -1.89
PDGFRB-210ENST00000522466 Q8N9L7 120 aa3.22□□□□□ -1.89
PDGFRB-210ENST00000522466 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.22□□□□□ -1.89
PDGFRB-210ENST00000522466 A0A1B0GW54 56 aa3.21□□□□□ -1.9
PDGFRB-210ENST00000522466 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.21□□□□□ -1.9
PDGFRB-210ENST00000522466 CXCL6P80162 114 aa3.2□□□□□ -1.9
PDGFRB-210ENST00000522466 BPY2O14599 106 aa3.19□□□□□ -1.9
PDGFRB-210ENST00000522466 PDE6GP18545 87 aa3.19□□□□□ -1.9
PDGFRB-210ENST00000522466 HSD52Q0P140 79 aa3.19□□□□□ -1.9
PDGFRB-210ENST00000522466 F8W1H4 67 aa3.18□□□□□ -1.9
PDGFRB-210ENST00000522466 BATFQ16520 125 aa3.18□□□□□ -1.9
PDGFRB-210ENST00000522466 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.18□□□□□ -1.9
PDGFRB-210ENST00000522466 ATXN8Q156A1 80 aa3.16□□□□□ -1.9
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP10-12P60413 245 aa3.15□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 K7EP34 96 aa3.14□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 MT4P47944 62 aa3.14□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 H0YAA0 97 aa3.12□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 TAX1BP3O14907 124 aa3.11□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.11□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 A0A1W2PPM0 123 aa3.1□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 NDUFC1O43677 76 aa3.1□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 LINC01554Q52M75 96 aa3.1□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.1□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 R4GN34 69 aa3.1□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.09□□□□□ -1.91
PDGFRB-210ENST00000522466 M0QZ58 72 aa3.08□□□□□ -1.92
PDGFRB-210ENST00000522466 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PDGFRB-210ENST00000522466 LCE1EQ5T753 118 aa3.08□□□□□ -1.92
PDGFRB-210ENST00000522466 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.07□□□□□ -1.92
PDGFRB-210ENST00000522466 ACYP1P07311 99 aa3.06□□□□□ -1.92
PDGFRB-210ENST00000522466 P0C880 135 aa3.06□□□□□ -1.92
PDGFRB-210ENST00000522466 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.04□□□□□ -1.92
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.04□□□□□ -1.92
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.03□□□□□ -1.92
PDGFRB-210ENST00000522466 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.02□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.02□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.02□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.01□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 UQCRQO14949 82 aa3□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 MT1EP04732 61 aa2.99□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.99□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 SMIM20Q8N5G0 67 aa2.99□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 TMEM258P61165 79 aa2.98□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 ETDBQ3ZM63 59 aa2.98□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 H3BT86 120 aa2.97□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 ATOX1O00244 68 aa2.97□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 C20orf197Q8N268 126 aa2.97□□□□□ -1.93
PDGFRB-210ENST00000522466 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.96□□□□□ -1.94
PDGFRB-210ENST00000522466 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.96□□□□□ -1.94
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.96□□□□□ -1.94
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.95□□□□□ -1.94
PDGFRB-210ENST00000522466 LINC00643Q86TS7 51 aa2.95□□□□□ -1.94
PDGFRB-210ENST00000522466 UBL5Q9BZL1 73 aa2.95□□□□□ -1.94
PDGFRB-210ENST00000522466 PRO0461Q9UI25 63 aa2.95□□□□□ -1.94
PDGFRB-210ENST00000522466 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PDGFRB-210ENST00000522466 PRO0628Q9UI54 55 aa2.94□□□□□ -1.94
PDGFRB-210ENST00000522466 MT-ATP8P03928 68 aa2.92□□□□□ -1.94
PDGFRB-210ENST00000522466 COX7CP15954 63 aa2.92□□□□□ -1.94
PDGFRB-210ENST00000522466 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa2.91□□□□□ -1.94
PDGFRB-210ENST00000522466 V9GYY9 64 aa2.9□□□□□ -1.95
PDGFRB-210ENST00000522466 H0Y9P7 68 aa2.89□□□□□ -1.95
PDGFRB-210ENST00000522466 MT1GP13640 62 aa2.89□□□□□ -1.95
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.89□□□□□ -1.95
PDGFRB-210ENST00000522466 MT1MQ8N339 61 aa2.88□□□□□ -1.95
PDGFRB-210ENST00000522466 SERP2Q8N6R1 65 aa2.88□□□□□ -1.95
PDGFRB-210ENST00000522466 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.87□□□□□ -1.95
PDGFRB-210ENST00000522466 CCDC179H3BU77 68 aa2.87□□□□□ -1.95
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