RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ENHOQ6UWT2 76 aa-3.73□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C14orf144Q96I85 54 aa-3.73□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EP400Q96L91 3159 aa-3.73□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMIM13P0DJ93 91 aa-3.74□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-3.74□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-3.74□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KAAG1Q9UBP8 84 aa-3.74□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MUC3AQ02505 3323 aa-3.74□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLASP1Q7Z460 1538 aa-3.75□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AKAP12Q02952 1782 aa-3.75□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF14Q15058 1648 aa-3.76□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A087WXM4 84 aa-3.76□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-3.76□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-3.77□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NHSQ6T4R5 1651 aa-3.78□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCC6O95255 1503 aa-3.79□□□□□ -3.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PREX2Q70Z35 1606 aa-3.79□□□□□ -3.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KDM5DQ9BY66 1539 aa-3.8□□□□□ -3.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S100A8P05109 93 aa-3.8□□□□□ -3.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB121Q5J5C9 76 aa-3.8□□□□□ -3.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PYY3Q5JQD4 70 aa-3.8□□□□□ -3.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-3.83□□□□□ -3.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNHG12Q9BXW3 62 aa-3.83□□□□□ -3.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABRACLQ9P1F3 81 aa-3.83□□□□□ -3.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC37Q6PGP7 1564 aa-3.85□□□□□ -3.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-3.86□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLI2P10070 1586 aa-3.86□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-3.87□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CEP250Q9BV73 2442 aa-3.87□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 M0R143 59 aa-3.87□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB114Q30KQ6 69 aa-3.87□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-3.89□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DIP2AQ14689 1571 aa-3.89□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-3.89□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-3.89□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-3.9□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TDRG1Q3Y452 100 aa-3.9□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-3.9□□□□□ -3.03
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-3.92□□□□□ -3.04
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-3.92□□□□□ -3.04
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-3.94□□□□□ -3.04
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-3.94□□□□□ -3.04
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIAM1Q13009 1591 aa-3.94□□□□□ -3.04
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MROH1Q8NDA8 1641 aa-3.95□□□□□ -3.04
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UACAQ9BZF9 1416 aa-3.95□□□□□ -3.04
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C3P01024 1663 aa-3.96□□□□□ -3.04
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EEA1Q15075 1411 aa-3.97□□□□□ -3.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-3.99□□□□□ -3.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCC3O15438 1527 aa-4□□□□□ -3.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3BUT2 72 aa-4.02□□□□□ -3.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3BVH4 76 aa-4.02□□□□□ -3.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-4.02□□□□□ -3.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-4.03□□□□□ -3.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PKIAP61925 76 aa-4.03□□□□□ -3.05
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ST20Q9HBF5 79 aa-4.07□□□□□ -3.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPS8Q8N3P4 1428 aa-4.08□□□□□ -3.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MADDQ8WXG6 1647 aa-4.09□□□□□ -3.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP34Q70CQ2 3546 aa-4.1□□□□□ -3.07
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q9H521 79 aa-4.1□□□□□ -3.07
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-4.11□□□□□ -3.07
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADIRFQ15847 76 aa-4.12□□□□□ -3.07
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 V9GYS6 101 aa-4.12□□□□□ -3.07
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCC1P33527 1531 aa-4.13□□□□□ -3.07
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 K7EMI3 77 aa-4.14□□□□□ -3.07
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB131AP59861 70 aa-4.14□□□□□ -3.07
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTTY10Q9BZA0 68 aa-4.14□□□□□ -3.07
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATXN8Q156A1 80 aa-4.16□□□□□ -3.08
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-4.17□□□□□ -3.08
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 M0R1W7 72 aa-4.17□□□□□ -3.08
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C18orf32Q8TCD1 76 aa-4.17□□□□□ -3.08
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UNC80Q8N2C7 3258 aa-4.17□□□□□ -3.08
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NMES1Q9C002 83 aa-4.18□□□□□ -3.08
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALS2Q96Q42 1657 aa-4.19□□□□□ -3.08
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-4.2□□□□□ -3.08
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-4.22□□□□□ -3.08
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-4.22□□□□□ -3.08
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-4.23□□□□□ -3.09
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-4.25□□□□□ -3.09
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMO7Q8WWI1 1683 aa-4.25□□□□□ -3.09
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-4.25□□□□□ -3.09
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S100A13Q99584 98 aa-4.28□□□□□ -3.09
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-4.28□□□□□ -3.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LOC400499M0QZD8 3231 aa-4.29□□□□□ -3.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC01549A6NIU2 74 aa-4.29□□□□□ -3.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGIPA6NJ69 53 aa-4.29□□□□□ -3.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCRIBQ14160 1630 aa-4.29□□□□□ -3.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNG13Q9P2W3 67 aa-4.32□□□□□ -3.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XIRP2A4UGR9 3374 aa-4.32□□□□□ -3.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-4.35□□□□□ -3.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYCP2Q9BX26 1530 aa-4.35□□□□□ -3.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MROH2AA6NES4 1674 aa-4.35□□□□□ -3.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCA8O94911 1581 aa-4.36□□□□□ -3.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SERF2P84101 59 aa-4.37□□□□□ -3.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-4.37□□□□□ -3.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TFF3Q07654 80 aa-4.38□□□□□ -3.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASPMQ8IZT6 3477 aa-4.39□□□□□ -3.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCA6Q8N139 1617 aa-4.42□□□□□ -3.12
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H0YGX0 51 aa-4.43□□□□□ -3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms