RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512755.1

N4BP2L2-215, Transcript of NEDD4 binding protein 2 like 2, human

TSL 2

Gene N4BP2L2, Length 1,273 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
N4BP2L2-215	ENST00000512755	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		0.27	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		0.27	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		0.27	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	COL7A1	Q02388	2944 aa		0.26	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		0.26	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		0.26	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	HERC2	O95714	4834 aa		0.26	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	USH2A	O75445	5202 aa		0.25	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	CEP290	O15078	2479 aa		0.25	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DNHD1	Q96M86	4753 aa		0.25	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755		M0QZ58	72 aa		0.25	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	TNP1	P09430	55 aa		0.25	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		0.25	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		0.25	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		0.24	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	ITPR2	Q14571	2701 aa		0.24	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	PKHD1	P08F94	4074 aa		0.24	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		0.24	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	NBAS	A2RRP1	2371 aa		0.24	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		0.23	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		0.23	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	SPRR2A	P35326	72 aa		0.23	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		0.23	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		0.22	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		0.22	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		0.22	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	LAMA3	Q16787	3333 aa		0.22	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	CUBN	O60494	3623 aa		0.22	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		0.22	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	0.22	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		0.22	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		0.22	□□□□□ -2.37
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		0.21	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	PCNT	O95613	3336 aa		0.21	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	LEAP2	Q969E1	77 aa		0.21	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	CEP350	Q5VT06	3117 aa		0.2	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	NF1	P21359	2839 aa		0.2	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	ACACA	Q13085	2346 aa		0.2	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	TACC2	O95359	2948 aa		0.2	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	SPG11	Q96JI7	2443 aa		0.2	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		0.2	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	SPEG	Q15772	3267 aa		0.2	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		0.2	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	FAT1	Q14517	4588 aa		0.2	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		0.19	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	ZZEF1	O43149	2961 aa		0.19	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		0.19	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	MT1A	P04731	61 aa		0.19	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		0.19	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	EP400	Q96L91	3159 aa		0.19	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		0.19	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		0.18	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	LRP2	P98164	4655 aa		0.18	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	FAM186A	A6NE01	2351 aa		0.18	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	SPRR2E	P22531	72 aa		0.18	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		0.18	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	TRIO	O75962	3097 aa		0.18	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	LRBA	P50851	2863 aa		0.18	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		0.17	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		0.17	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		0.17	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	LAMA5	O15230	3695 aa		0.17	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		0.16	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	MTOR	P42345	2549 aa		0.16	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		0.15	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	SZT2	Q5T011	3432 aa		0.15	□□□□□ -2.38
N4BP2L2-215	ENST00000512755	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		0.15	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		0.15	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		0.15	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	AKAP9	Q99996	3911 aa		0.14	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	HTT	P42858	3142 aa		0.14	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	EYS	Q5T1H1	3165 aa		0.14	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		0.14	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		0.13	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	CEP250	Q9BV73	2442 aa		0.13	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		0.13	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		0.13	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	FRY	Q5TBA9	3013 aa		0.12	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	CENPE	Q02224	2701 aa		0.12	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		0.12	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	LAMA1	P25391	3075 aa		0.12	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	RELN	P78509	3460 aa		0.12	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	C5orf42	Q9H799	3197 aa		0.11	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	CFAP54	Q96N23	3096 aa		0.11	□□□□□ -2.39
N4BP2L2-215	ENST00000512755	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		0.11	□□□□□ -2.39

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.2 ms