RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 Q8N8P6 123 aa-1.28□□□□□ -2.61
CMC1-211ENST00000495428 CGREF1Q99674 301 aa-1.28□□□□□ -2.61
CMC1-211ENST00000495428 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-1.28□□□□□ -2.61
CMC1-211ENST00000495428 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-1.28□□□□□ -2.61
CMC1-211ENST00000495428 A0A0G2JND7 137 aa-1.29□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 SNAPC5O75971 98 aa-1.29□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 S100A12P80511 92 aa-1.29□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-1.29□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 RPL39P5Q59GN2 51 aa-1.29□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 LZICQ8WZA0 190 aa-1.29□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 TRGV9Q99603 122 aa-1.29□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 COPZ2Q9P299 210 aa-1.29□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 K7EIM0 57 aa-1.3□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 PDCD5O14737 125 aa-1.31□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 C10orf113Q5VZT2 155 aa-1.31□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-1.31□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 RERGLQ9H628 205 aa-1.31□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-1.31□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 SERP1Q9Y6X1 66 aa-1.31□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 FCER1GP30273 86 aa-1.32□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 CRIP1P50238 77 aa-1.32□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-1.32□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 PDCD10Q9BUL8 212 aa-1.32□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 ABRACLQ9P1F3 81 aa-1.32□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 HIGD1BQ9P298 99 aa-1.32□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 NDUFB1O75438 58 aa-1.33□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 LINC00158P58513 81 aa-1.33□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 ARL11Q969Q4 196 aa-1.33□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 SPANXDQ9BXN6 97 aa-1.33□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-1.34□□□□□ -2.62
CMC1-211ENST00000495428 A0A087WXM4 84 aa-1.35□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 hADV29S1A0JD25 119 aa-1.35□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 COX7BP24311 80 aa-1.35□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 DR1Q01658 176 aa-1.35□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 SERP2Q8N6R1 65 aa-1.35□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-1.35□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 PFDN5Q99471 154 aa-1.35□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 IGLC1P0CG04 106 aa-1.36□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-1.36□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 F6UZH7 168 aa-1.37□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 H3BVH4 76 aa-1.37□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 ARPC4P59998 168 aa-1.37□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-1.37□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 C1orf54Q8WWF1 131 aa-1.37□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 UQCR10Q9UDW1 63 aa-1.37□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-1.38□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 I3L3M4 83 aa-1.38□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 TRAPPC2P0DI81 140 aa-1.38□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-1.38□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 CCDC58Q4VC31 144 aa-1.38□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 SNHG12Q9BXW3 62 aa-1.38□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 NMES1Q9C002 83 aa-1.38□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-1.39□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-1.4□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 SELENOWP63302 87 aa-1.4□□□□□ -2.63
CMC1-211ENST00000495428 ARMS2P0C7Q2 107 aa-1.41□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 C2orf88Q9BSF0 95 aa-1.41□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 CYB5AP00167 134 aa-1.42□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 APOC2P02655 101 aa-1.42□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-1.43□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-1.43□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 SMIM13P0DJ93 91 aa-1.43□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 SNCAP37840 140 aa-1.43□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 MEIG1Q5JSS6 88 aa-1.43□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 H3BQ15 152 aa-1.44□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 A0A1B0GWA3 101 aa-1.45□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 SEC11AP67812 179 aa-1.45□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 CORTO00230 105 aa-1.46□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 COX6CP09669 75 aa-1.46□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 CATR1Q13166 79 aa-1.46□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 DPY30Q9C005 99 aa-1.46□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 TMEM218A2RU14 115 aa-1.47□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 LEPROTL1O95214 131 aa-1.47□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 IGLC2P0DOY2 106 aa-1.47□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 C20orf78Q9BR46 151 aa-1.47□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 PSENENQ9NZ42 101 aa-1.47□□□□□ -2.64
CMC1-211ENST00000495428 FAM25AB3EWG3 89 aa-1.48□□□□□ -2.65
CMC1-211ENST00000495428 FAM25CB3EWG5 89 aa-1.48□□□□□ -2.65
CMC1-211ENST00000495428 FAM25GB3EWG6 89 aa-1.48□□□□□ -2.65
CMC1-211ENST00000495428 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
CMC1-211ENST00000495428 HMGN3Q15651 99 aa-1.48□□□□□ -2.65
CMC1-211ENST00000495428 H0Y9P7 68 aa-1.49□□□□□ -2.65
CMC1-211ENST00000495428 C12orf57Q99622 126 aa-1.49□□□□□ -2.65
CMC1-211ENST00000495428 A0A1B0GU69 56 aa-1.5□□□□□ -2.65
CMC1-211ENST00000495428 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
CMC1-211ENST00000495428 RBP2P50120 134 aa-1.5□□□□□ -2.65
CMC1-211ENST00000495428 ST20Q9HBF5 79 aa-1.5□□□□□ -2.65
CMC1-211ENST00000495428 ACBD7Q8N6N7 88 aa-1.51□□□□□ -2.65
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