RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 S100A1P23297 94 aa5.99□□□□□ -1.45
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PRPF40A-211ENST00000493468 HCG22E2RYF7 251 aa5.97□□□□□ -1.45
PRPF40A-211ENST00000493468 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.97□□□□□ -1.45
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PRPF40A-211ENST00000493468 CASC2Q6XLA1 102 aa5.94□□□□□ -1.46
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PRPF40A-211ENST00000493468 LINC00208Q96KT6 92 aa5.19□□□□□ -1.58
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PRPF40A-211ENST00000493468 MT1MQ8N339 61 aa5.11□□□□□ -1.59
PRPF40A-211ENST00000493468 MP68P56378 58 aa5.1□□□□□ -1.59
PRPF40A-211ENST00000493468 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PRPF40A-211ENST00000493468 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.07□□□□□ -1.6
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PRPF40A-211ENST00000493468 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.78□□□□□ -1.64
PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP12-4P60329 112 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF40A-211ENST00000493468 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF40A-211ENST00000493468 LCE3AQ5TA76 89 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF40A-211ENST00000493468 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PRPF40A-211ENST00000493468 SCGB1A1P11684 91 aa4.67□□□□□ -1.66
PRPF40A-211ENST00000493468 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.66□□□□□ -1.66
PRPF40A-211ENST00000493468 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
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