RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 ABCC2Q92887 1545 aa-1.66□□□□□ -2.67
ITGA4-211ENST00000490435 TIAM1Q13009 1591 aa-1.66□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1B0GUT8 65 aa-1.66□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 D6R8Y8 96 aa-1.66□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 GNGT2O14610 69 aa-1.66□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 HMGN3Q15651 99 aa-1.66□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 MROH1Q8NDA8 1641 aa-1.66□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 ALS2Q96Q42 1657 aa-1.67□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-1.67□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM218A2RU14 115 aa-1.67□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 MPC2O95563 127 aa-1.67□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 CD52P31358 61 aa-1.67□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.67□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 UQCRHP07919 91 aa-1.68□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 ACBD7Q8N6N7 88 aa-1.68□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB124Q8NES8 71 aa-1.68□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 PPLO60437 1756 aa-1.68□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 ABCC6O95255 1503 aa-1.69□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-1.69□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 ATOX1O00244 68 aa-1.69□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-1.69□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 KDM5DQ9BY66 1539 aa-1.7□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-1.7□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 A0A096LNI7 61 aa-1.7□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 S100A8P05109 93 aa-1.7□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 LINC00032P0C843 101 aa-1.7□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 HTN1P15515 57 aa-1.7□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB131AP59861 70 aa-1.7□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 PLGLAQ15195 96 aa-1.7□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 NREPQ16612 68 aa-1.7□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 ETDBQ3ZM63 59 aa-1.7□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-1.7□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 RALGAPBQ86X10 1494 aa-1.7□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 HFM1A2PYH4 1435 aa-1.71□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-1.71□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-1.71□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 UMAD1C9J7I0 102 aa-1.71□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB114Q30KQ6 69 aa-1.71□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 UBL5Q9BZL1 73 aa-1.71□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 MADDQ8WXG6 1647 aa-1.71□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-1.71□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 H3BUT2 72 aa-1.72□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 NDUFB1O75438 58 aa-1.72□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-1.72□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 LINC01556Q5JQF7 62 aa-1.72□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 ABRACLQ9P1F3 81 aa-1.72□□□□□ -2.68
ITGA4-211ENST00000490435 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-1.72□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-1.72□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 MROH2AA6NES4 1674 aa-1.73□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-1.73□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 RBP2P50120 134 aa-1.74□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 ENHOQ6UWT2 76 aa-1.74□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-1.74□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 AKAP12Q02952 1782 aa-1.75□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 SYCP2Q9BX26 1530 aa-1.75□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-1.75□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 CYB5AP00167 134 aa-1.75□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-1.75□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-1.76□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 TRPM2O94759 1503 aa-1.76□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-1.77□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 GYPAP02724 150 aa-1.77□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-1.78□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-1.78□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
ITGA4-211ENST00000490435 ADCY10Q96PN6 1610 aa-1.79□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 PRXQ9BXM0 1461 aa-1.79□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 CEP162Q5TB80 1403 aa-1.79□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB121Q5J5C9 76 aa-1.79□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM2Q9BVW6 85 aa-1.79□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 IGIPA6NJ69 53 aa-1.8□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 K7EMI3 77 aa-1.8□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 NMES1Q9C002 83 aa-1.8□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 DPY30Q9C005 99 aa-1.8□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-1.8□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 PEG3Q9GZU2 1588 aa-1.81□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 ABCC3O15438 1527 aa-1.81□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 TFF3Q07654 80 aa-1.81□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-1.81□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-1.82□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM13P0DJ93 91 aa-1.82□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-1.82□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.82□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-1.83□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 S100A10P60903 97 aa-1.83□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 ABCC1P33527 1531 aa-1.83□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-1.84□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 AGLP35573 1532 aa-1.84□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-1.84□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 FAUP35544 74 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 ABCA8O94911 1581 aa-1.85□□□□□ -2.7
ITGA4-211ENST00000490435 M0R1W7 72 aa-1.85□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-1.85□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 PEA15Q15121 130 aa-1.85□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 TDRG1Q3Y452 100 aa-1.85□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-1.85□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms