RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 H3BP45 60 aa-3.59□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 MT-ND4LP03901 98 aa-3.59□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 PMCHL1Q16048 86 aa-3.59□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa-3.59□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 PRO0628Q9UI54 55 aa-3.59□□□□□ -2.98
SNORD54-201ENST00000459159 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-3.6□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-3.6□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP-3.6□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC89Q8N998 374 aa-3.6□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 C1orf109Q9NX04 203 aa-3.6□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 COMMD8Q9NX08 183 aa-3.6□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-3.6□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 V9GYS6 101 aa-3.6□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP-3.61□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 DNM1P34Q6PK57 102 aa-3.61□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 UTS2BQ765I0 119 aa-3.61□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-3.61□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-3.61□□□□□ -2.99
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SNORD54-201ENST00000459159 A6NJY4 79 aa-3.62□□□□□ -2.99
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SNORD54-201ENST00000459159 BCAP31P51572 246 aa-3.62□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa-3.62□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP-3.62□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 S100A14Q9HCY8 104 aa-3.62□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa-3.62□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 SMLR1H3BR10 107 aa-3.63□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 SERF2P84101 59 aa-3.63□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 PMAIP1Q13794 54 aa-3.63□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 COPS9Q8WXC6 57 aa-3.63□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1B0GW15 77 aa-3.64□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 SSNA1O43805 119 aa-3.64□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 ATP6V1FQ16864 119 aa-3.64□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 ATP6V1E2Q96A05 226 aa-3.64□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 BANF2Q9H503 90 aa-3.64□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 CABP5Q9NP86 173 aa-3.64□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 GNG11P61952 73 aa-3.65□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 PFDN4Q9NQP4 134 aa-3.65□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 NDUFAF4Q9P032 175 aa-3.65□□□□□ -2.99
SNORD54-201ENST00000459159 E7ESA3 106 aa-3.66□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 PFDN6O15212 129 aa-3.66□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 NDUFB6O95139 128 aa-3.66□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 S100A9P06702 114 aaKnown RBP-3.66□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 CETN2P41208 172 aa-3.66□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa-3.66□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-3.66□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 CHRAC1Q9NRG0 131 aa-3.66□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 CTXN2P0C2S0 81 aa-3.67□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 LIN52Q52LA3 116 aa-3.67□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 CHMP6Q96FZ7 201 aa-3.67□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 AIF1LQ9BQI0 150 aa-3.67□□□□□ -3
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SNORD54-201ENST00000459159 SYCP3Q8IZU3 236 aa-3.68□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 M0R129 80 aa-3.69□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 ATXN8Q156A1 80 aa-3.69□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-3.69□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa-3.7□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 TNNC1P63316 161 aa-3.7□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 PDRG1Q9NUG6 133 aa-3.7□□□□□ -3
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SNORD54-201ENST00000459159 SLC51BQ86UW2 128 aa-3.71□□□□□ -3
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SNORD54-201ENST00000459159 TNNC2P02585 160 aa-3.72□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 ARPC4P59998 168 aa-3.72□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-3.72□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 AHSPQ9NZD4 102 aa-3.72□□□□□ -3
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM24O75264 130 aa-3.73□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 HMGN1P05114 100 aa-3.74□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-3.74□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 FABP9Q0Z7S8 132 aa-3.74□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-3.75□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-3.75□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 S100A13Q99584 98 aa-3.75□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 SIKE1Q9BRV8 207 aa-3.75□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP-3.75□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 KCNE2Q9Y6J6 123 aa-3.75□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 S100A1P23297 94 aa-3.76□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP-3.76□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 IFT20Q8IY31 132 aa-3.76□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM12Q96EX1 92 aa-3.76□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa-3.76□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 TRPC5OSA6NMA1 111 aa-3.77□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 PFDN1O60925 122 aa-3.77□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa-3.77□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 MYL6P60660 151 aa-3.78□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa-3.78□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM244Q5VVB8 128 aa-3.78□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 C12orf73Q69YU5 71 aa-3.78□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM20Q8N5G0 67 aa-3.78□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 HYPKQ9NX55 129 aa-3.78□□□□□ -3.01
SNORD54-201ENST00000459159 GNG4P50150 75 aa-3.79□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 SPHARQ15513 63 aa-3.79□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 OCC1Q8TAD7 63 aa-3.79□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 TBCAO75347 108 aaKnown RBP-3.8□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 TRIQKQ629K1 86 aa-3.8□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-3.8□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-3.8□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP-3.81□□□□□ -3.02
SNORD54-201ENST00000459159 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-3.82□□□□□ -3.02
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