RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 BSNQ9UPA5 3926 aa5.2□□□□□ -1.58
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.2□□□□□ -1.58
TNS1-207ENST00000430930 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.19□□□□□ -1.58
TNS1-207ENST00000430930 CUBNO60494 3623 aa5.18□□□□□ -1.58
TNS1-207ENST00000430930 COL7A1Q02388 2944 aa5.17□□□□□ -1.58
TNS1-207ENST00000430930 MT2AP02795 61 aa5.16□□□□□ -1.58
TNS1-207ENST00000430930 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
TNS1-207ENST00000430930 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
TNS1-207ENST00000430930 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.15□□□□□ -1.58
TNS1-207ENST00000430930 AKAP9Q99996 3911 aa5.13□□□□□ -1.59
TNS1-207ENST00000430930 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.1□□□□□ -1.59
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.1□□□□□ -1.59
TNS1-207ENST00000430930 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.09□□□□□ -1.59
TNS1-207ENST00000430930 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.09□□□□□ -1.6
TNS1-207ENST00000430930 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.08□□□□□ -1.6
TNS1-207ENST00000430930 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.04□□□□□ -1.6
TNS1-207ENST00000430930 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.04□□□□□ -1.6
TNS1-207ENST00000430930 MT1FP04733 61 aa5.02□□□□□ -1.61
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.01□□□□□ -1.61
TNS1-207ENST00000430930 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.99□□□□□ -1.61
TNS1-207ENST00000430930 VPS13CQ709C8 3753 aa4.99□□□□□ -1.61
TNS1-207ENST00000430930 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
TNS1-207ENST00000430930 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.97□□□□□ -1.61
TNS1-207ENST00000430930 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
TNS1-207ENST00000430930 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.94□□□□□ -1.62
TNS1-207ENST00000430930 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TNS1-207ENST00000430930 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.92□□□□□ -1.62
TNS1-207ENST00000430930 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.85□□□□□ -1.63
TNS1-207ENST00000430930 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.85□□□□□ -1.63
TNS1-207ENST00000430930 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.85□□□□□ -1.63
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.83□□□□□ -1.64
TNS1-207ENST00000430930 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.78□□□□□ -1.64
TNS1-207ENST00000430930 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.75□□□□□ -1.65
TNS1-207ENST00000430930 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.73□□□□□ -1.65
TNS1-207ENST00000430930 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.73□□□□□ -1.65
TNS1-207ENST00000430930 SPRR2EP22531 72 aa4.71□□□□□ -1.65
TNS1-207ENST00000430930 SPRR2BP35325 72 aa4.71□□□□□ -1.65
TNS1-207ENST00000430930 SPRR2AP35326 72 aa4.71□□□□□ -1.65
TNS1-207ENST00000430930 FAT1Q14517 4588 aa4.71□□□□□ -1.66
TNS1-207ENST00000430930 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TNS1-207ENST00000430930 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.7□□□□□ -1.66
TNS1-207ENST00000430930 ANK2Q01484 3957 aa4.67□□□□□ -1.66
TNS1-207ENST00000430930 MT1XP80297 61 aa4.65□□□□□ -1.66
TNS1-207ENST00000430930 HERC1Q15751 4861 aa4.64□□□□□ -1.67
TNS1-207ENST00000430930 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TNS1-207ENST00000430930 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.6□□□□□ -1.67
TNS1-207ENST00000430930 HSPG2P98160 4391 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-207ENST00000430930 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-207ENST00000430930 SPRR2DP22532 72 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-207ENST00000430930 MT1BP07438 61 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-207ENST00000430930 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TNS1-207ENST00000430930 RYR1P21817 5038 aa4.57□□□□□ -1.68
TNS1-207ENST00000430930 LCE3BQ5TA77 95 aa4.56□□□□□ -1.68
TNS1-207ENST00000430930 LCE2BO14633 110 aa4.56□□□□□ -1.68
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.53□□□□□ -1.68
TNS1-207ENST00000430930 DNHD1Q96M86 4753 aa4.53□□□□□ -1.68
TNS1-207ENST00000430930 MT1GP13640 62 aa4.53□□□□□ -1.68
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP12-4P60329 112 aa4.51□□□□□ -1.69
TNS1-207ENST00000430930 RYR3Q15413 4870 aa4.5□□□□□ -1.69
TNS1-207ENST00000430930 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.5□□□□□ -1.69
TNS1-207ENST00000430930 KMT2AQ03164 3969 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-207ENST00000430930 RYR2Q92736 4967 aa4.42□□□□□ -1.7
TNS1-207ENST00000430930 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.41□□□□□ -1.7
TNS1-207ENST00000430930 LCE2CQ5TA81 110 aa4.4□□□□□ -1.7
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.37□□□□□ -1.71
TNS1-207ENST00000430930 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.37□□□□□ -1.71
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.37□□□□□ -1.71
TNS1-207ENST00000430930 MYCBP2O75592 4640 aa4.37□□□□□ -1.71
TNS1-207ENST00000430930 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.37□□□□□ -1.71
TNS1-207ENST00000430930 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.35□□□□□ -1.71
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.32□□□□□ -1.72
TNS1-207ENST00000430930 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.32□□□□□ -1.72
TNS1-207ENST00000430930 MT1LQ93083 61 aa4.28□□□□□ -1.72
TNS1-207ENST00000430930 PKD1P98161 4303 aa4.28□□□□□ -1.72
TNS1-207ENST00000430930 LYSTQ99698 3801 aa4.23□□□□□ -1.73
TNS1-207ENST00000430930 MT1EP04732 61 aa4.22□□□□□ -1.73
TNS1-207ENST00000430930 MUC17Q685J3 4493 aa4.16□□□□□ -1.74
TNS1-207ENST00000430930 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.15□□□□□ -1.74
TNS1-207ENST00000430930 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-207ENST00000430930 MT3P25713 68 aa4.1□□□□□ -1.75
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.1□□□□□ -1.75
TNS1-207ENST00000430930 MT1MQ8N339 61 aa4.1□□□□□ -1.75
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.1□□□□□ -1.75
TNS1-207ENST00000430930 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.07□□□□□ -1.76
TNS1-207ENST00000430930 TNXBP22105 4242 aa4.06□□□□□ -1.76
TNS1-207ENST00000430930 HERC2O95714 4834 aa4.01□□□□□ -1.77
TNS1-207ENST00000430930 PKHD1P08F94 4074 aa4□□□□□ -1.77
TNS1-207ENST00000430930 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
TNS1-207ENST00000430930 LPAP08519 4548 aa3.98□□□□□ -1.77
TNS1-207ENST00000430930 MT4P47944 62 aa3.96□□□□□ -1.77
TNS1-207ENST00000430930 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.95□□□□□ -1.78
TNS1-207ENST00000430930 PRM1P04553 51 aa3.94□□□□□ -1.78
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.92□□□□□ -1.78
TNS1-207ENST00000430930 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.91□□□□□ -1.78
TNS1-207ENST00000430930 LRP2P98164 4655 aa3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms