RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP10-12P60413 245 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-202ENST00000400053 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-202ENST00000400053 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-202ENST00000400053 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-202ENST00000400053 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP12-3P60328 96 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-202ENST00000400053 DNHD1Q96M86 4753 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-202ENST00000400053 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-202ENST00000400053 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-202ENST00000400053 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-202ENST00000400053 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-202ENST00000400053 KMT2AQ03164 3969 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH2Q9P225 4427 aa3.78□□□□□ -1.8
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PTPRM-202ENST00000400053 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-202ENST00000400053 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-202ENST00000400053 FAT1Q14517 4588 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRM-202ENST00000400053 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP10-5P60370 271 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-202ENST00000400053 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-202ENST00000400053 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRM-202ENST00000400053 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRM-202ENST00000400053 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-202ENST00000400053 RYR1P21817 5038 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-202ENST00000400053 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-202ENST00000400053 PKHD1P08F94 4074 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRM-202ENST00000400053 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
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PTPRM-202ENST00000400053 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-202ENST00000400053 MYCBP2O75592 4640 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-202ENST00000400053 MT1HP80294 61 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-202ENST00000400053 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-202ENST00000400053 MT2AP02795 61 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-202ENST00000400053 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-202ENST00000400053 RYR3Q15413 4870 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRM-202ENST00000400053 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-202ENST00000400053 MT3P25713 68 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRM-202ENST00000400053 HERC2O95714 4834 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-202ENST00000400053 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-202ENST00000400053 TNXBP22105 4242 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-202ENST00000400053 MT1XP80297 61 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRM-202ENST00000400053 MT1BP07438 61 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-202ENST00000400053 LPAP08519 4548 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-202ENST00000400053 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-202ENST00000400053 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.18□□□□□ -1.9
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PTPRM-202ENST00000400053 HERC1Q15751 4861 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-202ENST00000400053 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-202ENST00000400053 SPRR2EP22531 72 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-202ENST00000400053 SPRR2BP35325 72 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-202ENST00000400053 SPRR2AP35326 72 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-202ENST00000400053 LCE3BQ5TA77 95 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRM-202ENST00000400053 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRM-202ENST00000400053 MUC2Q02817 5179 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-202ENST00000400053 LCE2BO14633 110 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-202ENST00000400053 MT1GP13640 62 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-202ENST00000400053 SPRR2DP22532 72 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-202ENST00000400053 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-202ENST00000400053 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-202ENST00000400053 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-202ENST00000400053 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-202ENST00000400053 RNF213Q63HN8 5207 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-202ENST00000400053 MT1LQ93083 61 aa2.88□□□□□ -1.95
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