RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-201ENST00000344528 DNHD1Q96M86 4753 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE3AQ5TA76 89 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-201ENST00000344528 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-201ENST00000344528 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP4-201ENST00000344528 INE1O15225 51 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-201ENST00000344528 AKAP9Q99996 3911 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-201ENST00000344528 MT1HP80294 61 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP4-201ENST00000344528 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.73□□□□□ -1.33
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-201ENST00000344528 RYR1P21817 5038 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-201ENST00000344528 MT2AP02795 61 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-201ENST00000344528 FAT1Q14517 4588 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-201ENST00000344528 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.65□□□□□ -1.35
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH2Q9P225 4427 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-201ENST00000344528 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-201ENST00000344528 MT1FP04733 61 aa6.5□□□□□ -1.37
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SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.46□□□□□ -1.37
SH3BP4-201ENST00000344528 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP10-5P60370 271 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-201ENST00000344528 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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SH3BP4-201ENST00000344528 ANK2Q01484 3957 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.24□□□□□ -1.41
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SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-201ENST00000344528 RYR2Q92736 4967 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4-201ENST00000344528 MYCBP2O75592 4640 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4-201ENST00000344528 KMT2AQ03164 3969 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4-201ENST00000344528 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4-201ENST00000344528 LYSTQ99698 3801 aa6.09□□□□□ -1.44
SH3BP4-201ENST00000344528 HERC2O95714 4834 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-201ENST00000344528 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-201ENST00000344528 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.97□□□□□ -1.45
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SH3BP4-201ENST00000344528 MT1BP07438 61 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4-201ENST00000344528 HERC1Q15751 4861 aa5.9□□□□□ -1.46
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SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4-201ENST00000344528 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4-201ENST00000344528 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRR2EP22531 72 aa5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRR2BP35325 72 aa5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRR2AP35326 72 aa5.85□□□□□ -1.47
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP4-201ENST00000344528 PKD1P98161 4303 aa5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPG2P98160 4391 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4-201ENST00000344528 LRP2P98164 4655 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4-201ENST00000344528 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-201ENST00000344528 MT1GP13640 62 aa5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-201ENST00000344528 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE2BO14633 110 aa5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRR2DP22532 72 aa5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4-201ENST00000344528 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4-201ENST00000344528 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE3BQ5TA77 95 aa5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4-201ENST00000344528 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP12-4P60329 112 aa5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4-201ENST00000344528 PKHD1P08F94 4074 aa5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.48□□□□□ -1.53
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SH3BP4-201ENST00000344528 MUC17Q685J3 4493 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4-201ENST00000344528 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4-201ENST00000344528 LPAP08519 4548 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4-201ENST00000344528 MT1LQ93083 61 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4-201ENST00000344528 MT1EP04732 61 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4-201ENST00000344528 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4-201ENST00000344528 TNXBP22105 4242 aa5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4-201ENST00000344528 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4-201ENST00000344528 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
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