RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253332.5

AKAP12-201, Transcript of A-kinase anchoring protein 12, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP12, Length 6,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP12-201ENST00000253332 VPS13CQ709C8 3753 aa6.54□□□□□ -1.36
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
AKAP12-201ENST00000253332 BSNQ9UPA5 3926 aa6.42□□□□□ -1.38
AKAP12-201ENST00000253332 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.41□□□□□ -1.38
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.31□□□□□ -1.4
AKAP12-201ENST00000253332 MT1HP80294 61 aa6.31□□□□□ -1.4
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.27□□□□□ -1.41
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
AKAP12-201ENST00000253332 AKAP9Q99996 3911 aa6.2□□□□□ -1.42
AKAP12-201ENST00000253332 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.15□□□□□ -1.42
AKAP12-201ENST00000253332 SPRR2EP22531 72 aa6.11□□□□□ -1.43
AKAP12-201ENST00000253332 SPRR2BP35325 72 aa6.11□□□□□ -1.43
AKAP12-201ENST00000253332 SPRR2AP35326 72 aa6.11□□□□□ -1.43
AKAP12-201ENST00000253332 MT2AP02795 61 aa6.11□□□□□ -1.43
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.07□□□□□ -1.44
AKAP12-201ENST00000253332 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.05□□□□□ -1.44
AKAP12-201ENST00000253332 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.03□□□□□ -1.44
AKAP12-201ENST00000253332 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
AKAP12-201ENST00000253332 MT1FP04733 61 aa6.02□□□□□ -1.45
AKAP12-201ENST00000253332 DNAH2Q9P225 4427 aa5.93□□□□□ -1.46
AKAP12-201ENST00000253332 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.89□□□□□ -1.47
AKAP12-201ENST00000253332 SPRR2DP22532 72 aa5.89□□□□□ -1.47
AKAP12-201ENST00000253332 LCE3BQ5TA77 95 aa5.85□□□□□ -1.47
AKAP12-201ENST00000253332 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
AKAP12-201ENST00000253332 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.81□□□□□ -1.48
AKAP12-201ENST00000253332 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.79□□□□□ -1.48
AKAP12-201ENST00000253332 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.79□□□□□ -1.48
AKAP12-201ENST00000253332 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.78□□□□□ -1.48
AKAP12-201ENST00000253332 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.77□□□□□ -1.48
AKAP12-201ENST00000253332 ANK2Q01484 3957 aa5.76□□□□□ -1.49
AKAP12-201ENST00000253332 FAT1Q14517 4588 aa5.72□□□□□ -1.49
AKAP12-201ENST00000253332 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.72□□□□□ -1.49
AKAP12-201ENST00000253332 LCE2BO14633 110 aa5.71□□□□□ -1.49
AKAP12-201ENST00000253332 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.7□□□□□ -1.5
AKAP12-201ENST00000253332 MT1GP13640 62 aa5.7□□□□□ -1.5
AKAP12-201ENST00000253332 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.69□□□□□ -1.5
AKAP12-201ENST00000253332 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.69□□□□□ -1.5
AKAP12-201ENST00000253332 KMT2AQ03164 3969 aa5.68□□□□□ -1.5
AKAP12-201ENST00000253332 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.64□□□□□ -1.51
AKAP12-201ENST00000253332 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.63□□□□□ -1.51
AKAP12-201ENST00000253332 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.62□□□□□ -1.51
AKAP12-201ENST00000253332 DNHD1Q96M86 4753 aa5.59□□□□□ -1.51
AKAP12-201ENST00000253332 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
AKAP12-201ENST00000253332 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.58□□□□□ -1.52
AKAP12-201ENST00000253332 LYSTQ99698 3801 aa5.56□□□□□ -1.52
AKAP12-201ENST00000253332 RYR1P21817 5038 aa5.55□□□□□ -1.52
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP12-4P60329 112 aa5.54□□□□□ -1.52
AKAP12-201ENST00000253332 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.53□□□□□ -1.52
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.53□□□□□ -1.52
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.52□□□□□ -1.53
AKAP12-201ENST00000253332 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.49□□□□□ -1.53
AKAP12-201ENST00000253332 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.48□□□□□ -1.53
AKAP12-201ENST00000253332 LCE2CQ5TA81 110 aa5.43□□□□□ -1.54
AKAP12-201ENST00000253332 MT4P47944 62 aa5.42□□□□□ -1.54
AKAP12-201ENST00000253332 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
AKAP12-201ENST00000253332 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
AKAP12-201ENST00000253332 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.39□□□□□ -1.55
AKAP12-201ENST00000253332 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.38□□□□□ -1.55
AKAP12-201ENST00000253332 MT1XP80297 61 aa5.36□□□□□ -1.55
AKAP12-201ENST00000253332 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.33□□□□□ -1.56
AKAP12-201ENST00000253332 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.32□□□□□ -1.56
AKAP12-201ENST00000253332 RYR3Q15413 4870 aa5.25□□□□□ -1.57
AKAP12-201ENST00000253332 MT1BP07438 61 aa5.24□□□□□ -1.57
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.24□□□□□ -1.57
AKAP12-201ENST00000253332 LPAP08519 4548 aa5.23□□□□□ -1.57
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.22□□□□□ -1.57
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.22□□□□□ -1.57
AKAP12-201ENST00000253332 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.21□□□□□ -1.58
AKAP12-201ENST00000253332 MYCBP2O75592 4640 aa5.16□□□□□ -1.58
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.14□□□□□ -1.59
AKAP12-201ENST00000253332 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.13□□□□□ -1.59
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.12□□□□□ -1.59
AKAP12-201ENST00000253332 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
AKAP12-201ENST00000253332 HSPG2P98160 4391 aa5.08□□□□□ -1.6
AKAP12-201ENST00000253332 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.08□□□□□ -1.6
AKAP12-201ENST00000253332 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.06□□□□□ -1.6
AKAP12-201ENST00000253332 LCE1DQ5T752 114 aa5.06□□□□□ -1.6
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.05□□□□□ -1.6
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.05□□□□□ -1.6
AKAP12-201ENST00000253332 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.01□□□□□ -1.61
AKAP12-201ENST00000253332 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5□□□□□ -1.61
AKAP12-201ENST00000253332 PKHD1P08F94 4074 aa5□□□□□ -1.61
AKAP12-201ENST00000253332 PKD1P98161 4303 aa4.98□□□□□ -1.61
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.94□□□□□ -1.62
AKAP12-201ENST00000253332 PRM1P04553 51 aa4.93□□□□□ -1.62
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.91□□□□□ -1.62
AKAP12-201ENST00000253332 MT1LQ93083 61 aa4.88□□□□□ -1.63
AKAP12-201ENST00000253332 MT1EP04732 61 aa4.84□□□□□ -1.63
AKAP12-201ENST00000253332 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.84□□□□□ -1.63
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP12-201ENST00000253332 MT3P25713 68 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.79□□□□□ -1.64
AKAP12-201ENST00000253332 MT1MQ8N339 61 aa4.78□□□□□ -1.64
AKAP12-201ENST00000253332 LRP2P98164 4655 aa4.76□□□□□ -1.65
AKAP12-201ENST00000253332 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.73□□□□□ -1.65
AKAP12-201ENST00000253332 HERC1Q15751 4861 aa4.72□□□□□ -1.65
AKAP12-201ENST00000253332 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.7□□□□□ -1.66
AKAP12-201ENST00000253332 TNXBP22105 4242 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms