RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 TIMM17BO60830 172 aa3.43□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.43□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.43□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.43□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 Q96NJ1 140 aa3.43□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.42□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 PLNP26678 52 aa3.42□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 Q6JHZ5 121 aa3.42□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 SVBPQ8N300 66 aa3.42□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.42□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 CLEC2BQ92478 149 aa3.42□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.42□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 BATFQ16520 125 aa3.41□□□□□ -1.86
SENP3-210ENST00000619785 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 ZNF815PA8K554 130 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 FAM236CP0DP71 79 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 LINC00313P59037 77 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 NPC2P61916 151 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 LST1O00453 97 aa3.37□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 DPM2O94777 84 aa3.37□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.36□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 IGKCP01834 107 aa3.36□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 F8WEM9 126 aa3.35□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 TRGC2P03986 189 aa3.35□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.35□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.35□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 R4GN34 69 aa3.35□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.34□□□□□ -1.87
SENP3-210ENST00000619785 LEPROTL1O95214 131 aa3.33□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.33□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 A6NN06 94 aa3.32□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 MT1BP07438 61 aa3.32□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 LINC00575Q6W349 94 aa3.32□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 IFITM1P13164 125 aa3.31□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 FABP4P15090 132 aa3.31□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.31□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.31□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 A0A1B0GU33 70 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 Q6ZQY7 126 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 HIST1H2BKO60814 126 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 HIST1H2BJP06899 126 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 HIST1H2BOP23527 126 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 HIST1H2BBP33778 126 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 HIST1H2BDP58876 126 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 HIST1H2BCP62807 126 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 TEN1Q86WV5 123 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 COPS9Q8WXC6 57 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 PMAIP1Q13794 54 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP3-210ENST00000619785 hADV29S1A0JD25 119 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 LINC01545Q5VT33 79 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 A0A087WSZ3 146 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 H3BUT2 72 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 SPINK7P58062 85 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 C12orf57Q99622 126 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 C3orf79P0CE67 100 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 KRTDAPP60985 99 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 A0A1B0GV90 55 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.22□□□□□ -1.89
SENP3-210ENST00000619785 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 A0A1B0GW54 56 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 A0A1W2PNM2 257 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 Q5VV11 94 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 RAB37Q96AX2 223 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 SIGMAR1Q99720 223 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.21□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 SPRR2EP22531 72 aa3.2□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 SPRR2BP35325 72 aa3.2□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 SPRR2AP35326 72 aa3.2□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.2□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 ATOH7Q8N100 152 aa3.2□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 IGKV4-1P06312 121 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 SMIM6P0DI80 62 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 A8MUN3 132 aa3.17□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 H3BPC8 53 aa3.17□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.17□□□□□ -1.9
SENP3-210ENST00000619785 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms