RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTLL3-233	ENST00000602338		A6NJY4	79 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTLL3-233	ENST00000602338		H3BMG7	143 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00313	P59037	77 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TTLL3-233	ENST00000602338	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV4-1	P06312	121 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TTLL3-233	ENST00000602338	PRO0461	Q9UI25	63 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TTLL3-233	ENST00000602338		H0YGX0	51 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTLL3-233	ENST00000602338	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTLL3-233	ENST00000602338	MTURN	Q8N3F0	131 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0B4J2C4	111 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTLL3-233	ENST00000602338	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GV72	72 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TTLL3-233	ENST00000602338		K7ERJ3	54 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SNCG	O76070	127 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GX51	115 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ETDB	Q3ZM63	59 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIAP1	O43715	76 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TTLL3-233	ENST00000602338	GHRH	P01286	108 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CCK	P06307	115 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00846	Q9NV44	126 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GVX0	72 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SPINK7	P58062	85 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAC	P01848	142 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338	C8orf87	E5RJ46	101 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMB2	P49721	201 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MWP4	228 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAL4	O96015	105 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ATXN8	Q156A1	80 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338		H3BT86	120 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338	COX6C	P09669	75 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TTLL3-233	ENST00000602338		C9JAW5	83 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTLL3-233	ENST00000602338		H3BQ85	93 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTLL3-233	ENST00000602338	MT-ATP8	P03928	68 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TTLL3-233	ENST00000602338	NEB	P20929	6669 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ACYP1	P07311	99 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TTLL3-233	ENST00000602338		J3KT08	172 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
TTLL3-233	ENST00000602338	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		5.58	□□□□□ -1.52
TTLL3-233	ENST00000602338	IMUP	Q9GZP8	106 aa		5.58	□□□□□ -1.52
TTLL3-233	ENST00000602338	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		5.58	□□□□□ -1.52
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZQT0	140 aa		5.57	□□□□□ -1.52
TTLL3-233	ENST00000602338	DSCR8	Q96T75	97 aa		5.57	□□□□□ -1.52
TTLL3-233	ENST00000602338	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		5.55	□□□□□ -1.52
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFB1	O75438	58 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TTLL3-233	ENST00000602338	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZVQ6	151 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00643	Q86TS7	51 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TTLL3-233	ENST00000602338	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR15	Q8IV56	129 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	MT1B	P07438	61 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338		A6NN06	94 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV2-30	P06310	120 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GW54	56 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UQCRQ	O14949	82 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338		K7EQZ3	153 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFS5	O43920	106 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338		Q5W150	140 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	hDV103S1	A0JD37	113 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	ATOX1	O00244	68 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	COX7C	P15954	63 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	NREP	Q16612	68 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	PDE6G	P18545	87 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	C4orf26	Q17RF5	130 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	C5orf47	Q569G3	176 aa		5.37	□□□□□ -1.55

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