RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 TCL1BO95988 128 aa2.72□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 Q6JHZ5 121 aa2.72□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 Q6Q795 121 aa2.72□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.72□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 A8MUU9 505 aa2.71□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.71□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 C14orf144Q96I85 54 aa2.71□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.71□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 HIGD1BQ9P298 99 aa2.71□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 A0A1W2PNM2 257 aa2.7□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 S100A2P29034 98 aa2.7□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 CXCL6P80162 114 aa2.7□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 VAMP3Q15836 100 aa2.7□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H4GQ99525 98 aa2.7□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 A0A0B4J2C4 111 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 F8WEM9 126 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 FXYD2P54710 66 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.69□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 LST1O00453 97 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 S100A1P23297 94 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 SPATA45Q537H7 98 aa2.68□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 A0A087WSZ3 146 aa2.67□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 M0R2T5 61 aa2.67□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 MT2AP02795 61 aa2.67□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 S100A6P06703 90 aa2.67□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.67□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 TEN1Q86WV5 123 aa2.67□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 CEND1Q8N111 149 aa2.67□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 SNHG12Q9BXW3 62 aa2.67□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 H0YGX0 51 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP5-8O75690 187 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 HRES1P13985 223 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 PRO0461Q9UI25 63 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
HERC3-212ENST00000597259 A0A1B0GX51 115 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 H3BMG7 143 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 K7ERJ3 54 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 MT1FP04733 61 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 PYY3Q5JQD4 70 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 RAB37Q96AX2 223 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 VAMP8Q9BV40 100 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.63□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa2.62□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 A0A1B0GV72 72 aa2.62□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 FABP2P12104 132 aa2.62□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 IGKV4-1P06312 121 aa2.61□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 LINC00313P59037 77 aa2.61□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 HSD52Q0P140 79 aa2.6□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.6□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 SIGMAR1Q99720 223 aa2.6□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.6□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 CCKP06307 115 aa2.59□□□□□ -1.99
HERC3-212ENST00000597259 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.58□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 A0A1B0GVX0 72 aa2.58□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.58□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 TRACP01848 142 aa2.58□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.56□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 SNCGO76070 127 aa2.56□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 DNAL4O96015 105 aa2.56□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 PSMB2P49721 201 aa2.56□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 Q6ZQT0 140 aa2.56□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 UQCR10Q9UDW1 63 aa2.56□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 C8orf87E5RJ46 101 aa2.55□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 H3BQ85 93 aa2.55□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.54□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.54□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 SPINK7P58062 85 aa2.54□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP10-10P60014 251 aa2.54□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.54□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa2.53□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 COX6CP09669 75 aa2.53□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 FAM236CP0DP71 79 aa2.53□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 VPS25Q9BRG1 176 aa2.53□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.53□□□□□ -2
HERC3-212ENST00000597259 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.52□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.52□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 C9JAW5 83 aa2.52□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 C8orf17Q9NRJ1 99 aa2.52□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 A8MWP4 228 aa2.51□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 J3KT08 172 aa2.51□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 DSCR8Q96T75 97 aa2.51□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 SCGB1C2P0DMR2 95 aa2.5□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 WFDC13Q8IUB5 93 aa2.5□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 PRR15Q8IV56 129 aa2.5□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 NEBP20929 6669 aa2.49□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 Q5W150 140 aa2.49□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.49□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 A0A1B0GW54 56 aa2.48□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2.48□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 K7EQZ3 153 aa2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms