RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BQ85 93 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6JHZ5 121 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 DSCR8Q96T75 97 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A087WSZ3 146 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.43□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 HERC1Q15751 4861 aa3.43□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.42□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.42□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 MYCBP2O75592 4640 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 MUC2Q02817 5179 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 SPINK1P00995 79 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 CD164Q04900 197 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6Q795 121 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 Q96NJ1 140 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00846Q9NV44 126 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP5-9P26371 169 aa3.39□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf195Q5TG92 126 aa3.39□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.39□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.39□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR4Q16378 134 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 TNXBP22105 4242 aa3.38□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE6GP18545 87 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZVQ6 151 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 SIGMAR1Q99720 223 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 LIMD2Q9BT23 127 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV4-1P06312 121 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 NREPQ16612 68 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8N9L7 120 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0A0MQY5 61 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf92A6NGG3 77 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 DSCR10P59022 87 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 Q5XG85 94 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 BPY2O14599 106 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-208ENST00000589162 K7EQZ3 153 aa3.33□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 SEC61GP60059 68 aa3.33□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 UBL5Q9BZL1 73 aa3.33□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.32□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.31□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 J3QR89 54 aa3.31□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GW54 56 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 A8MWP4 228 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 K7ERU9 68 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 ACYP1P07311 99 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A087WVE0 104 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GVX0 72 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 MT-ATP8P03928 68 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR15Q8IV56 129 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-208ENST00000589162 J3KT08 172 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00313P59037 77 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00643Q86TS7 51 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFB1O75438 58 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 TPRXLQ17RH7 258 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV2-30P06310 120 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCL6P80162 114 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 C8orf87E5RJ46 101 aa3.24□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 CASC2Q6XLA1 102 aa3.24□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 LPAP08519 4548 aa3.24□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 hDV103S1A0JD37 113 aa3.23□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 HCG22E2RYF7 251 aa3.23□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.23□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFS5O43920 106 aa3.22□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 PCOTHQ58A44 107 aa3.22□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.22□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.22□□□□□ -1.89
CAPNS1-208ENST00000589162 A8MUU9 505 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-208ENST00000589162 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-208ENST00000589162 Q75L30 129 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-208ENST00000589162 C5orf47Q569G3 176 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-208ENST00000589162 Q5W150 140 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.18□□□□□ -1.9
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.18□□□□□ -1.9
CAPNS1-208ENST00000589162 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
CAPNS1-208ENST00000589162 LRP2P98164 4655 aa3.15□□□□□ -1.9
CAPNS1-208ENST00000589162 MT3P25713 68 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 IMUPQ9GZP8 106 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 V9GYY9 64 aa3.15□□□□□ -1.91
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