RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.99□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 SMIM29Q86T20 159 aa4.99□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.98□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 HCG22E2RYF7 251 aa4.98□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.98□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 IGFL1Q6UW32 110 aa4.97□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.97□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PNN7 141 aa4.96□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 MP68P56378 58 aa4.96□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 SCXQ7RTU7 201 aa4.96□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.96□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.95□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 PRLHP81277 87 aa4.95□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 A8MWP4 228 aa4.94□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 DSCR10P59022 87 aa4.94□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 LINC00483Q53H64 154 aa4.94□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 A0A087WSZ3 146 aa4.93□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.93□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.93□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 A0A087WTM6 91 aa4.92□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 hDV103S1A0JD37 113 aa4.92□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 MOBPQ13875 183 aa4.92□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 PRR15Q8IV56 129 aa4.92□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.92□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 K7EQZ3 153 aa4.91□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 Q8N9L7 120 aa4.91□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.91□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 SNURFQ9Y675 71 aa4.91□□□□□ -1.62
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZSA8 131 aa4.9□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.9□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 CD164Q04900 197 aa4.89□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 CASC2Q6XLA1 102 aa4.89□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.89□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.88□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 PANO1I0J062 215 aa4.88□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 ZNF861PO60384 105 aa4.88□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.88□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 CHTF8P0CG12 524 aa4.87□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 V9GYY9 64 aa4.87□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 MUC17Q685J3 4493 aa4.87□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.84□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.84□□□□□ -1.63
GGA3-218ENST00000584243 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.83□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 C1orf195Q5TG92 126 aa4.82□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.82□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 C8orf87E5RJ46 101 aa4.81□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 H0Y9P7 68 aa4.81□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.81□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 Q5XG85 94 aa4.81□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GVX0 72 aa4.8□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 IGLV7-43P04211 117 aa4.8□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.8□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.79□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.79□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.79□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 Q1T7F1 81 aa4.78□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.78□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 LINC00208Q96KT6 92 aa4.78□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.78□□□□□ -1.64
GGA3-218ENST00000584243 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.77□□□□□ -1.65
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GGA3-218ENST00000584243 PRO0628Q9UI54 55 aa4.77□□□□□ -1.65
GGA3-218ENST00000584243 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.77□□□□□ -1.65
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GGA3-218ENST00000584243 KRTAP10-8P60410 259 aa4.75□□□□□ -1.65
GGA3-218ENST00000584243 Q96NJ1 140 aa4.75□□□□□ -1.65
GGA3-218ENST00000584243 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.74□□□□□ -1.65
GGA3-218ENST00000584243 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.74□□□□□ -1.65
GGA3-218ENST00000584243 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
GGA3-218ENST00000584243 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.74□□□□□ -1.65
GGA3-218ENST00000584243 C4orf26Q17RF5 130 aa4.73□□□□□ -1.65
GGA3-218ENST00000584243 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.73□□□□□ -1.65
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GGA3-218ENST00000584243 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.72□□□□□ -1.65
GGA3-218ENST00000584243 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.71□□□□□ -1.66
GGA3-218ENST00000584243 A0A0G2JQZ4 141 aa4.71□□□□□ -1.66
GGA3-218ENST00000584243 NDUFS5O43920 106 aa4.7□□□□□ -1.66
GGA3-218ENST00000584243 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.68□□□□□ -1.66
GGA3-218ENST00000584243 SPINK1P00995 79 aa4.67□□□□□ -1.66
GGA3-218ENST00000584243 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.66□□□□□ -1.66
GGA3-218ENST00000584243 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.66□□□□□ -1.66
GGA3-218ENST00000584243 LINC00313P59037 77 aa4.65□□□□□ -1.67
GGA3-218ENST00000584243 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.64□□□□□ -1.67
GGA3-218ENST00000584243 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.63□□□□□ -1.67
GGA3-218ENST00000584243 COA5Q86WW8 74 aa4.63□□□□□ -1.67
GGA3-218ENST00000584243 BRK1Q8WUW1 75 aa4.63□□□□□ -1.67
GGA3-218ENST00000584243 ACYP2P14621 99 aa4.62□□□□□ -1.67
GGA3-218ENST00000584243 Q75L30 129 aa4.6□□□□□ -1.67
GGA3-218ENST00000584243 PRR4Q16378 134 aa4.59□□□□□ -1.67
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.59□□□□□ -1.67
GGA3-218ENST00000584243 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.59□□□□□ -1.67
GGA3-218ENST00000584243 PRR15LQ9BU68 103 aa4.59□□□□□ -1.67
GGA3-218ENST00000584243 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.58□□□□□ -1.68
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