RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 PRO0461Q9UI25 63 aa7.81□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.8□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 H3BT86 120 aa7.8□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.8□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.8□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 TEN1Q86WV5 123 aa7.8□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.79□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 MT1FP04733 61 aa7.79□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 FAM236CP0DP71 79 aa7.79□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 SIGMAR1Q99720 223 aa7.79□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 LCE2BO14633 110 aa7.78□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 MTURNQ8N3F0 131 aa7.77□□□□□ -1.17
NME3-211ENST00000568561 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.77□□□□□ -1.17
NME3-211ENST00000568561 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.76□□□□□ -1.17
NME3-211ENST00000568561 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
NME3-211ENST00000568561 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
NME3-211ENST00000568561 A0A1W2PNM2 257 aa7.73□□□□□ -1.17
NME3-211ENST00000568561 HRES1P13985 223 aa7.72□□□□□ -1.17
NME3-211ENST00000568561 KRTAP10-10P60014 251 aa7.71□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.71□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.71□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 J3QR89 54 aa7.7□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 LINC00313P59037 77 aa7.7□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.7□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 A0A1B0GV72 72 aa7.69□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.69□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 IGKV4-1P06312 121 aa7.69□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.68□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 K7ERU9 68 aa7.67□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.67□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 ETDBQ3ZM63 59 aa7.67□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.66□□□□□ -1.18
NME3-211ENST00000568561 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.63□□□□□ -1.19
NME3-211ENST00000568561 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.63□□□□□ -1.19
NME3-211ENST00000568561 PDE6GP18545 87 aa7.62□□□□□ -1.19
NME3-211ENST00000568561 DSCR8Q96T75 97 aa7.62□□□□□ -1.19
NME3-211ENST00000568561 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.62□□□□□ -1.19
NME3-211ENST00000568561 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.6□□□□□ -1.19
NME3-211ENST00000568561 Q6ZQT0 140 aa7.6□□□□□ -1.19
NME3-211ENST00000568561 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.59□□□□□ -1.19
NME3-211ENST00000568561 CCKP06307 115 aa7.56□□□□□ -1.2
NME3-211ENST00000568561 A0A1B0GW54 56 aa7.54□□□□□ -1.2
NME3-211ENST00000568561 ACYP1P07311 99 aa7.53□□□□□ -1.2
NME3-211ENST00000568561 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.52□□□□□ -1.21
NME3-211ENST00000568561 A0A1B0GVX0 72 aa7.52□□□□□ -1.21
NME3-211ENST00000568561 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.51□□□□□ -1.21
NME3-211ENST00000568561 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
NME3-211ENST00000568561 VPS25Q9BRG1 176 aa7.51□□□□□ -1.21
NME3-211ENST00000568561 SPINK7P58062 85 aa7.5□□□□□ -1.21
NME3-211ENST00000568561 C8orf87E5RJ46 101 aa7.49□□□□□ -1.21
NME3-211ENST00000568561 LINC00846Q9NV44 126 aa7.46□□□□□ -1.22
NME3-211ENST00000568561 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.44□□□□□ -1.22
NME3-211ENST00000568561 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
NME3-211ENST00000568561 A8MWP4 228 aa7.42□□□□□ -1.22
NME3-211ENST00000568561 NREPQ16612 68 aa7.39□□□□□ -1.23
NME3-211ENST00000568561 Q6ZVQ6 151 aa7.39□□□□□ -1.23
NME3-211ENST00000568561 J3KT08 172 aa7.38□□□□□ -1.23
NME3-211ENST00000568561 UBL5Q9BZL1 73 aa7.38□□□□□ -1.23
NME3-211ENST00000568561 LINC00643Q86TS7 51 aa7.36□□□□□ -1.23
NME3-211ENST00000568561 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.35□□□□□ -1.23
NME3-211ENST00000568561 NDUFB1O75438 58 aa7.34□□□□□ -1.23
NME3-211ENST00000568561 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.33□□□□□ -1.24
NME3-211ENST00000568561 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.33□□□□□ -1.24
NME3-211ENST00000568561 NEBP20929 6669 aa7.31□□□□□ -1.24
NME3-211ENST00000568561 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.3□□□□□ -1.24
NME3-211ENST00000568561 BPY2O14599 106 aa7.3□□□□□ -1.24
NME3-211ENST00000568561 CXCL6P80162 114 aa7.28□□□□□ -1.24
NME3-211ENST00000568561 IMUPQ9GZP8 106 aa7.28□□□□□ -1.24
NME3-211ENST00000568561 MT-ATP8P03928 68 aa7.25□□□□□ -1.25
NME3-211ENST00000568561 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.25□□□□□ -1.25
NME3-211ENST00000568561 PRR15Q8IV56 129 aa7.23□□□□□ -1.25
NME3-211ENST00000568561 K7EQZ3 153 aa7.22□□□□□ -1.25
NME3-211ENST00000568561 SCGB1A1P11684 91 aa7.22□□□□□ -1.25
NME3-211ENST00000568561 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.21□□□□□ -1.26
NME3-211ENST00000568561 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.2□□□□□ -1.26
NME3-211ENST00000568561 Q8N9L7 120 aa7.19□□□□□ -1.26
NME3-211ENST00000568561 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
NME3-211ENST00000568561 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.18□□□□□ -1.26
NME3-211ENST00000568561 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.17□□□□□ -1.26
NME3-211ENST00000568561 NDUFS5O43920 106 aa7.17□□□□□ -1.26
NME3-211ENST00000568561 IGKV2-30P06310 120 aa7.17□□□□□ -1.26
NME3-211ENST00000568561 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NME3-211ENST00000568561 hDV103S1A0JD37 113 aa7.13□□□□□ -1.27
NME3-211ENST00000568561 HCG22E2RYF7 251 aa7.11□□□□□ -1.27
NME3-211ENST00000568561 Q5W150 140 aa7.11□□□□□ -1.27
NME3-211ENST00000568561 A0A087WVE0 104 aa7.1□□□□□ -1.27
NME3-211ENST00000568561 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.09□□□□□ -1.27
NME3-211ENST00000568561 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.09□□□□□ -1.27
NME3-211ENST00000568561 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.09□□□□□ -1.27
NME3-211ENST00000568561 CASC2Q6XLA1 102 aa7.08□□□□□ -1.28
NME3-211ENST00000568561 A6NN06 94 aa7.07□□□□□ -1.28
NME3-211ENST00000568561 C4orf26Q17RF5 130 aa7.07□□□□□ -1.28
NME3-211ENST00000568561 ATOX1O00244 68 aa7.06□□□□□ -1.28
NME3-211ENST00000568561 MT1BP07438 61 aa7.05□□□□□ -1.28
NME3-211ENST00000568561 C5orf47Q569G3 176 aa7.05□□□□□ -1.28
NME3-211ENST00000568561 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.04□□□□□ -1.28
NME3-211ENST00000568561 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.9 ms