RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552123.1

NPIPB12-208, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family, member B12, human

TSL 4

Gene NPIPB12, Length 464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB12-208	ENST00000552123	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123		Q8N377	158 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A1B0GW54	56 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	CCK	P06307	115 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	UBE2B	P63146	152 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123		H7BZZ5	65 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123		Q6ZQT0	140 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	PRLH	P81277	87 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NPIPB12-208	ENST00000552123	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	ZNF861P	O60384	105 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	UBE2A	P49459	152 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A1W2PNM2	257 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123		Q8NBF4	154 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123		F8WEM9	126 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A087WVE0	104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	NDUFS5	O43920	106 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	CXCL6	P80162	114 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123		Q1T7F1	81 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123		Q6ZVQ6	151 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	NREP	Q16612	68 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NPIPB12-208	ENST00000552123	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	HAMP	P81172	84 aa		4	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A087WSZ3	146 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A0G2JQZ4	141 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	BPY2	O14599	106 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	MOBP	Q13875	183 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	SNURF	Q9Y675	71 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	TNXB	P22105	4242 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A087X002	238 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	hDV103S1	A0JD37	113 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	C8orf87	E5RJ46	101 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	DSCR10	P59022	87 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGKV4-1	P06312	121 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	LCA10	Q71F78	164 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123		Q96NJ1	140 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NPIPB12-208	ENST00000552123	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
NPIPB12-208	ENST00000552123	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		3.96	□□□□□ -1.78
NPIPB12-208	ENST00000552123		A6NN06	94 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NPIPB12-208	ENST00000552123		A8MWP4	228 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NPIPB12-208	ENST00000552123	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NPIPB12-208	ENST00000552123	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NPIPB12-208	ENST00000552123	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NPIPB12-208	ENST00000552123	SPINK1	P00995	79 aa		3.92	□□□□□ -1.78
NPIPB12-208	ENST00000552123		K7EQZ3	153 aa		3.91	□□□□□ -1.78
NPIPB12-208	ENST00000552123	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		3.91	□□□□□ -1.78
NPIPB12-208	ENST00000552123		Q8N9L7	120 aa		3.91	□□□□□ -1.78
NPIPB12-208	ENST00000552123	LIMD2	Q9BT23	127 aa		3.91	□□□□□ -1.78
NPIPB12-208	ENST00000552123		A8MUN3	132 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NPIPB12-208	ENST00000552123	NDUFB1	O75438	58 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NPIPB12-208	ENST00000552123	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NPIPB12-208	ENST00000552123	OCR1	Q9BZK8	76 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NPIPB12-208	ENST00000552123	HCG22	E2RYF7	251 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NPIPB12-208	ENST00000552123		Q5VV11	94 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NPIPB12-208	ENST00000552123	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A1B0GVX0	72 aa		3.88	□□□□□ -1.79
NPIPB12-208	ENST00000552123	PSPHP1	O15172	72 aa		3.88	□□□□□ -1.79

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