RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 Q6ZR54 194 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 H3BPC8 53 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 LIMD2Q9BT23 127 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-214ENST00000543184 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-214ENST00000543184 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-214ENST00000543184 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-214ENST00000543184 RTL8CO15255 209 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-214ENST00000543184 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-214ENST00000543184 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-214ENST00000543184 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-214ENST00000543184 C14orf177Q52M58 125 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-214ENST00000543184 HRES1P13985 223 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-214ENST00000543184 A0A087WTM6 91 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 SPINK7P58062 85 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.45□□□□□ -1.06
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PRAME-214ENST00000543184 KRTAP10-2P60368 255 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 Q75L30 129 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 PKD1P98161 4303 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 Q5W150 140 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 CDK2AP2O75956 126 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-214ENST00000543184 A6NN06 94 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-214ENST00000543184 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-214ENST00000543184 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-214ENST00000543184 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-214ENST00000543184 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-214ENST00000543184 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-214ENST00000543184 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-214ENST00000543184 LINC00483Q53H64 154 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-214ENST00000543184 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-214ENST00000543184 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PRAME-214ENST00000543184 ZNF861PO60384 105 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-214ENST00000543184 KRTAP10-1P60331 282 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-214ENST00000543184 FAT1Q14517 4588 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-214ENST00000543184 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-214ENST00000543184 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PRAME-214ENST00000543184 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-214ENST00000543184 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-214ENST00000543184 PRAC1Q96KF2 57 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-214ENST00000543184 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-214ENST00000543184 A0A1B0GVY2 172 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-214ENST00000543184 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
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PRAME-214ENST00000543184 ACYP2P14621 99 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-214ENST00000543184 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-214ENST00000543184 C8orf87E5RJ46 101 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-214ENST00000543184 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-214ENST00000543184 LINC00313P59037 77 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-214ENST00000543184 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-214ENST00000543184 IGKV2-30P06310 120 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-214ENST00000543184 A0A1B0GU69 56 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-214ENST00000543184 DMAC1Q96GE9 116 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-214ENST00000543184 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PRAME-214ENST00000543184 HSPG2P98160 4391 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-214ENST00000543184 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-214ENST00000543184 SPINK1P00995 79 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-214ENST00000543184 Q6ZSA8 131 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-214ENST00000543184 RYR1P21817 5038 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-214ENST00000543184 FAM229AH3BQW9 127 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-214ENST00000543184 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-214ENST00000543184 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-214ENST00000543184 MYCBP2O75592 4640 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-214ENST00000543184 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-214ENST00000543184 Q8N1X5 172 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-214ENST00000543184 H3BS24 57 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-214ENST00000543184 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-214ENST00000543184 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PRAME-214ENST00000543184 LINC01554Q52M75 96 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-214ENST00000543184 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-214ENST00000543184 UQCR11O14957 56 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-214ENST00000543184 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-214ENST00000543184 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PRAME-214ENST00000543184 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-214ENST00000543184 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.9□□□□□ -1.15
PRAME-214ENST00000543184 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-214ENST00000543184 Q5VSD8 79 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-214ENST00000543184 CSAG1Q6PB30 78 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-214ENST00000543184 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-214ENST00000543184 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PRAME-214ENST00000543184 HERC2O95714 4834 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-214ENST00000543184 C9orf92A6NGG3 77 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-214ENST00000543184 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PRAME-214ENST00000543184 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.81□□□□□ -1.16
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