RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATXN3-212	ENST00000515746	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATXN3-212	ENST00000515746		Q96NJ1	140 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATXN3-212	ENST00000515746	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746		K7EIL1	84 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	CHTF8	P0CG12	524 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	LIMD2	Q9BT23	127 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	C14orf177	Q52M58	125 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00483	Q53H64	154 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746		Q75L30	129 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746		A8MU10	97 aa		3	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	CD164	Q04900	197 aa		3	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	PMAIP1	Q13794	54 aa		3	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	MOBP	Q13875	183 aa		3	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZR54	194 aa		3	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	COA5	Q86WW8	74 aa		3	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	PANO1	I0J062	215 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR15L	Q9BU68	103 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	APLN	Q9ULZ1	77 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	TENM2	Q9NT68	2774 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV2-30	P06310	120 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	SEC61G	P60059	68 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	LCA10	Q71F78	164 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1B0GVX0	72 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ATXN3-212	ENST00000515746	COL7A1	Q02388	2944 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746		A6NN06	94 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	HRES1	P13985	223 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A087X002	238 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	PCOTH	Q58A44	107 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	FBN3	Q75N90	2809 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746		A6NED7	52 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A087WTM6	91 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF861P	O60384	105 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	SPINK7	P58062	85 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746		Q5W150	140 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFS5	O43920	106 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	CDK2AP2	O75956	126 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	KMT2A	Q03164	3969 aa		2.89	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	NUPR2	A6NF83	97 aa		2.88	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	C8orf87	E5RJ46	101 aa		2.88	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		2.88	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	DMAC1	Q96GE9	116 aa		2.88	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		2.88	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		2.88	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		2.87	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	RTL8C	O15255	209 aa		2.87	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV7-43	P04211	117 aa		2.87	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	PKD1	P98161	4303 aa		2.86	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		2.86	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	DNHD1	Q96M86	4753 aa		2.86	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		2.85	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	ACYP2	P14621	99 aa		2.85	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ATXN3-212	ENST00000515746	TG	P01266	2768 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ATXN3-212	ENST00000515746	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00313	P59037	77 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ATXN3-212	ENST00000515746	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
ATXN3-212	ENST00000515746	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ATXN3-212	ENST00000515746	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		2.82	□□□□□ -1.96

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