RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 LCE2CQ5TA81 110 aa10.17□□□□□ -0.78
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPCS1Q9Y6A9 102 aa10.16□□□□□ -0.78
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.15□□□□□ -0.78
USP46-AS1-201ENST00000503051 COX6B2Q6YFQ2 88 aa10.14□□□□□ -0.79
USP46-AS1-201ENST00000503051 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa10.14□□□□□ -0.79
USP46-AS1-201ENST00000503051 MT1HP80294 61 aa10.12□□□□□ -0.79
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa10.11□□□□□ -0.79
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A1B0GW54 56 aa10.11□□□□□ -0.79
USP46-AS1-201ENST00000503051 A8MUU9 505 aa10.11□□□□□ -0.79
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00313P59037 77 aa10.11□□□□□ -0.79
USP46-AS1-201ENST00000503051 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.09□□□□□ -0.79
USP46-AS1-201ENST00000503051 J3KT08 172 aa10.08□□□□□ -0.8
USP46-AS1-201ENST00000503051 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10.08□□□□□ -0.8
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A1B0GVX0 72 aa10.07□□□□□ -0.8
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa10.07□□□□□ -0.8
USP46-AS1-201ENST00000503051 M0R2T5 61 aa10.05□□□□□ -0.8
USP46-AS1-201ENST00000503051 K7EP34 96 aa10.04□□□□□ -0.8
USP46-AS1-201ENST00000503051 C8orf87E5RJ46 101 aa10.03□□□□□ -0.8
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10□□□□□ -0.81
USP46-AS1-201ENST00000503051 NREPQ16612 68 aa9.99□□□□□ -0.81
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRO0461Q9UI25 63 aa9.99□□□□□ -0.81
USP46-AS1-201ENST00000503051 A8MWP4 228 aa9.98□□□□□ -0.81
USP46-AS1-201ENST00000503051 NDUFB1O75438 58 aa9.98□□□□□ -0.81
USP46-AS1-201ENST00000503051 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa9.94□□□□□ -0.82
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
USP46-AS1-201ENST00000503051 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.92□□□□□ -0.82
USP46-AS1-201ENST00000503051 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.91□□□□□ -0.82
USP46-AS1-201ENST00000503051 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRR15Q8IV56 129 aa9.89□□□□□ -0.83
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6ZVQ6 151 aa9.85□□□□□ -0.83
USP46-AS1-201ENST00000503051 K7EQZ3 153 aa9.84□□□□□ -0.83
USP46-AS1-201ENST00000503051 BPY2O14599 106 aa9.84□□□□□ -0.83
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
USP46-AS1-201ENST00000503051 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.82□□□□□ -0.84
USP46-AS1-201ENST00000503051 F8W1H4 67 aa9.82□□□□□ -0.84
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa9.78□□□□□ -0.84
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM236CP0DP71 79 aa9.78□□□□□ -0.84
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.78□□□□□ -0.84
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00846Q9NV44 126 aa9.78□□□□□ -0.84
USP46-AS1-201ENST00000503051 ETDBQ3ZM63 59 aa9.77□□□□□ -0.85
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBL5Q9BZL1 73 aa9.76□□□□□ -0.85
USP46-AS1-201ENST00000503051 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.76□□□□□ -0.85
USP46-AS1-201ENST00000503051 hDV103S1A0JD37 113 aa9.75□□□□□ -0.85
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q8N9L7 120 aa9.75□□□□□ -0.85
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
USP46-AS1-201ENST00000503051 HRES1P13985 223 aa9.73□□□□□ -0.85
USP46-AS1-201ENST00000503051 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.72□□□□□ -0.85
USP46-AS1-201ENST00000503051 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.69□□□□□ -0.86
USP46-AS1-201ENST00000503051 NDUFS5O43920 106 aa9.68□□□□□ -0.86
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPINK7P58062 85 aa9.68□□□□□ -0.86
USP46-AS1-201ENST00000503051 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.68□□□□□ -0.86
USP46-AS1-201ENST00000503051 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.68□□□□□ -0.86
USP46-AS1-201ENST00000503051 CASC2Q6XLA1 102 aa9.65□□□□□ -0.86
USP46-AS1-201ENST00000503051 HCG22E2RYF7 251 aa9.59□□□□□ -0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CXCL6P80162 114 aa9.57□□□□□ -0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A1B0GV90 55 aa9.54□□□□□ -0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q5W150 140 aa9.53□□□□□ -0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.52□□□□□ -0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa9.52□□□□□ -0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 ACYP1P07311 99 aa9.51□□□□□ -0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa9.49□□□□□ -0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGKV2-30P06310 120 aa9.49□□□□□ -0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.47□□□□□ -0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa9.43□□□□□ -0.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 MT2AP02795 61 aa9.42□□□□□ -0.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.38□□□□□ -0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP10-10P60014 251 aa9.37□□□□□ -0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 MT1FP04733 61 aa9.36□□□□□ -0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00643Q86TS7 51 aa9.31□□□□□ -0.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.3□□□□□ -0.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 C4orf26Q17RF5 130 aa9.29□□□□□ -0.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A087WVE0 104 aa9.23□□□□□ -0.93
USP46-AS1-201ENST00000503051 J3QR89 54 aa9.23□□□□□ -0.93
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.23□□□□□ -0.93
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.22□□□□□ -0.93
USP46-AS1-201ENST00000503051 USH2AO75445 5202 aa9.22□□□□□ -0.93
USP46-AS1-201ENST00000503051 UQCRQO14949 82 aa9.16□□□□□ -0.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.15□□□□□ -0.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.14□□□□□ -0.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.14□□□□□ -0.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.14□□□□□ -0.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 SSPOA2VEC9 5147 aa9.14□□□□□ -0.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 H0Y9P7 68 aa9.11□□□□□ -0.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATOX1O00244 68 aa9.1□□□□□ -0.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.08□□□□□ -0.96
USP46-AS1-201ENST00000503051 S4R3F8 94 aa9.06□□□□□ -0.96
USP46-AS1-201ENST00000503051 OCR1Q9BZK8 76 aa9.04□□□□□ -0.96
USP46-AS1-201ENST00000503051 C5orf47Q569G3 176 aa9.02□□□□□ -0.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 LCA10Q71F78 164 aa9□□□□□ -0.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.99□□□□□ -0.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 K7ERU9 68 aa8.98□□□□□ -0.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 MP68P56378 58 aa8.97□□□□□ -0.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00208Q96KT6 92 aa8.97□□□□□ -0.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCGB1A1P11684 91 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms