RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487280.1

WDPCP-215, Transcript of WD repeat containing planar cell polarity effector, humanhuman

TSL 4

Gene WDPCP, Length 524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDPCP-215ENST00000487280 MAP3K1Q13233 1512 aa-0.75□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 SMARCA2P51531 1590 aa-0.75□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-0.75□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-0.76□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-0.76□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 TRIOO75962 3097 aa-0.77□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-0.77□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 ABCC1P33527 1531 aa-0.77□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 ERVK-7P63135 1459 aa-0.77□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 S4R3F8 94 aa-0.77□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 C5orf42Q9H799 3197 aa-0.78□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 KDM5DQ9BY66 1539 aa-0.78□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-0.78□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.78□□□□□ -2.53
WDPCP-215ENST00000487280 COL12A1Q99715 3063 aa-0.79□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.79□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 RICTORQ6R327 1708 aa-0.79□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-0.79□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 C18orf32Q8TCD1 76 aa-0.8□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-0.8□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-0.8□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 CRIP1P50238 77 aa-0.81□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 UBL5Q9BZL1 73 aa-0.81□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.81□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 HFM1A2PYH4 1435 aa-0.81□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-0.82□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 MT1HP80294 61 aa-0.82□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 ITSN1Q15811 1721 aa-0.82□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.82□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-0.83□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.83□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.84□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 ENHOQ6UWT2 76 aa-0.84□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 TJP1Q07157 1748 aa-0.84□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 CEP295Q9C0D2 2601 aa-0.85□□□□□ -2.54
WDPCP-215ENST00000487280 LRBAP50851 2863 aa-0.85□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 CHD7Q9P2D1 2997 aa-0.85□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 MYO9AB2RTY4 2548 aa-0.86□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.86□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-0.86□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-0.87□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-0.87□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 H3BVH4 76 aa-0.87□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 WT1-ASQ06250 92 aa-0.87□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.88□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-0.88□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-0.88□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-0.89□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.89□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-0.9□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 ITPR1Q14643 2758 aa-0.9□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-0.9□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-0.9□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.9□□□□□ -2.55
WDPCP-215ENST00000487280 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-0.91□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 EYSQ5T1H1 3165 aa-0.92□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 ABCA8O94911 1581 aa-0.92□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 NRAPQ86VF7 1730 aa-0.92□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.94□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.94□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 DIP2AQ14689 1571 aa-0.94□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-0.95□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 DEFB1P60022 68 aa-0.95□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 ATXN8Q156A1 80 aa-0.95□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 DEFB114Q30KQ6 69 aa-0.95□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 KIF1AQ12756 1690 aa-0.96□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 NHSQ6T4R5 1651 aa-0.96□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 MT1XP80297 61 aa-0.96□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 C6orf48Q9UBA6 75 aa-0.96□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 MGAQ8IWI9 3026 aa-0.96□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.97□□□□□ -2.56
WDPCP-215ENST00000487280 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-0.98□□□□□ -2.57
WDPCP-215ENST00000487280 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.98□□□□□ -2.57
WDPCP-215ENST00000487280 H3BUA1 57 aa-0.98□□□□□ -2.57
WDPCP-215ENST00000487280 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
WDPCP-215ENST00000487280 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-0.98□□□□□ -2.57
WDPCP-215ENST00000487280 ABCC6O95255 1503 aa-0.99□□□□□ -2.57
WDPCP-215ENST00000487280 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-0.99□□□□□ -2.57
WDPCP-215ENST00000487280 FCER1GP30273 86 aa-0.99□□□□□ -2.57
WDPCP-215ENST00000487280 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-0.99□□□□□ -2.57
WDPCP-215ENST00000487280 LY75O60449 1722 aa-0.99□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms