RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 WNK1Q9H4A3 2382 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 POLQO75417 2590 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 HIVEP1P15822 2718 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 ROMO1P60602 79 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 CENPEQ02224 2701 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A087WSZ3 146 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A096LPF7 62 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 AKAP6Q13023 2319 aa2.31□□□□□ -2.04
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RABGGTB-210ENST00000485459 APCP25054 2843 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 F8P00451 2351 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa2.3□□□□□ -2.04
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RABGGTB-210ENST00000485459 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 A8MWP4 228 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 DEFB130BP0DP73 79 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-210ENST00000485459 DEFB130AP0DP74 79 aa2.29□□□□□ -2.04
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RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PNN7 141 aa2.28□□□□□ -2.04
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RABGGTB-210ENST00000485459 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.27□□□□□ -2.05
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RABGGTB-210ENST00000485459 VPS13CQ709C8 3753 aa2.27□□□□□ -2.05
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RABGGTB-210ENST00000485459 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.26□□□□□ -2.052e-10■■■■■ 56.8
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RABGGTB-210ENST00000485459 P0C880 135 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-210ENST00000485459 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.26□□□□□ -2.05
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RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-210ENST00000485459 ACANP16112 2415 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-210ENST00000485459 RYR3Q15413 4870 aa2.22□□□□□ -2.05
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RABGGTB-210ENST00000485459 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.21□□□□□ -2.06
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RABGGTB-210ENST00000485459 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.21□□□□□ -2.06
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RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-210ENST00000485459 Q96NJ1 140 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-210ENST00000485459 ZANQ9Y493 2812 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-210ENST00000485459 STAB1Q9NY15 2570 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-210ENST00000485459 CSPG4Q6UVK1 2322 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-210ENST00000485459 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-210ENST00000485459 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
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