RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 SPRR1BP22528 89 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 MOBPQ13875 183 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00483Q53H64 154 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 CRYGAP11844 174 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01600Q96MT4 127 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 OCIAD2Q56VL3 154 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 F8WEM9 126 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 OXTP01178 125 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 MT1HL1P0DM35 61 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 IGFL1Q6UW32 110 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 MYCBP2O75592 4640 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 TNXBP22105 4242 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 H3BT86 120 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 ETDBQ3ZM63 59 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 VPS25Q9BRG1 176 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PNM2 257 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 F8W1H4 67 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 H3BQ85 93 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 DSCR8Q96T75 97 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 CCKP06307 115 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 Q6JHZ5 121 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 TEN1Q86WV5 123 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-211ENST00000484135 A0A087WSZ3 146 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZQT0 140 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 V9GYY9 64 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 SPINK1P00995 79 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 CD164Q04900 197 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 PDE6GP18545 87 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 Q6Q795 121 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 PP632Q6XCG6 107 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf195Q5TG92 126 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 LIMD2Q9BT23 127 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00846Q9NV44 126 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 NREPQ16612 68 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 Q96NJ1 140 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GVX0 72 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV4-1P06312 121 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 SIGMAR1Q99720 223 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf92A6NGG3 77 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 Q5XG85 94 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 Q8N9L7 120 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 HERC1Q15751 4861 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 LPAP08519 4548 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 UBL5Q9BZL1 73 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GW54 56 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 J3QR89 54 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 BPY2O14599 106 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0U1RQV1 116 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 K7EQZ3 153 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 K7ERU9 68 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 ACYP1P07311 99 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 A8MWP4 228 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 PSPHP1O15172 72 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 J3KT08 172 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFB1O75438 58 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00313P59037 77 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 WFDC13Q8IUB5 93 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 PRR15Q8IV56 129 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-211ENST00000484135 A0A087WVE0 104 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-211ENST00000484135 MT-ATP8P03928 68 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00643Q86TS7 51 aa2.52□□□□□ -2.01
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