RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479588.1

PTPRG-AS1-207, PTPRG antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRG-AS1, Length 725 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 COL7A1Q02388 2944 aa0.14□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 IQGAP2Q13576 1575 aa0.14□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.14□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 FLNCQ14315 2725 aa0.14□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 AKAP13Q12802 2813 aa0.14□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 AGLP35573 1532 aa0.13□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 EFCAB6Q5THR3 1501 aa0.13□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 CLTCL1P53675 1640 aa0.13□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 CACNA1AO00555 2505 aa0.13□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 LRRK2Q5S007 2527 aa0.13□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.13□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 H0YGX0 51 aa0.13□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 RPS27P42677 84 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 S4R3F8 94 aa0.13□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 NF1P21359 2839 aa0.13□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa0.13□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 MTORP42345 2549 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 C9orf92A6NGG3 77 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 PLNP26678 52 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 COL6A3P12111 3177 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 TENM2Q9NT68 2774 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 PDZD2O15018 2839 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 COL6A5A8TX70 2615 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 HSPG2P98160 4391 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 TGP01266 2768 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 H3BNG1 76 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 LINC00308Q8TCZ7 52 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 CMC2Q9NRP2 79 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 ABRACLQ9P1F3 81 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 STAB2Q8WWQ8 2551 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 EPG5Q9HCE0 2579 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 SACSQ9NZJ4 4579 aa0.09□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 CCDC168Q8NDH2 2452 aa0.09□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa0.09□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.39
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 SPRR2AP35326 72 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 DNAH3Q8TD57 4116 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 PKHD1P08F94 4074 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 SNRPGP15A8MWD9 76 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 DNAH2Q9P225 4427 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 HTTP42858 3142 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 ACACBO00763 2458 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 LRP2P98164 4655 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 HIVEP1P15822 2718 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 AKAP9Q99996 3911 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 SVEP1Q4LDE5 3571 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 NEBP20929 6669 aa0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 DNAH9Q9NYC9 4486 aa0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 TACC2O95359 2948 aa0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 TLN2Q9Y4G6 2542 aa0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 NBEAQ8NFP9 2946 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 TRPM2O94759 1503 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 NFAT5O94916 1531 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 M0QY20 66 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 SPRR2EP22531 72 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 DEFB110Q30KQ9 67 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 WFDC10BQ8IUB3 73 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 KAAG1Q9UBP8 84 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 COL12A1Q99715 3063 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 MYO18BQ8IUG5 2567 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 STAB1Q9NY15 2570 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 KALRNO60229 2985 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 DNAH6Q9C0G6 4158 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 CUBNO60494 3623 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 FRYQ5TBA9 3013 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 MXRA5Q9NR99 2828 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 LINC01546A6NGU7 62 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 A8MTW9 85 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 TNP1P09430 55 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 FASNP49327 2511 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 MT1AP04731 61 aa0.03□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 DEFB131AP59861 70 aa0.03□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 SMIM2Q9BVW6 85 aa0.03□□□□□ -2.4
PTPRG-AS1-207ENST00000479588 DNAH11Q96DT5 4516 aa0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms