RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473298.6

SOGA3-205, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SOGA3, Length 3,350 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-205ENST00000473298 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 PRR15LQ9BU68 103 aa5.95□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.94□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.94□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.94□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.93□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.93□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 IGKV2-30P06310 120 aa5.93□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.93□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.92□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.92□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.92□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.92□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 C9orf92A6NGG3 77 aa5.92□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.91□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 SPINK1P00995 79 aa5.9□□□□□ -1.46
SOGA3-205ENST00000473298 A0A1B0GVX0 72 aa5.89□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 FAT1Q14517 4588 aa5.89□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.89□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.88□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 SPRR1BP22528 89 aa5.88□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 A6NED7 52 aa5.87□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 C8orf87E5RJ46 101 aa5.87□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 PKHD1P08F94 4074 aa5.87□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.86□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 Q5W150 140 aa5.86□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 Q96NJ1 140 aa5.86□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.85□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.85□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SOGA3-205ENST00000473298 A0A1B0GW54 56 aa5.83□□□□□ -1.48
SOGA3-205ENST00000473298 LINC00313P59037 77 aa5.83□□□□□ -1.48
SOGA3-205ENST00000473298 COA5Q86WW8 74 aa5.83□□□□□ -1.48
SOGA3-205ENST00000473298 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.83□□□□□ -1.48
SOGA3-205ENST00000473298 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.82□□□□□ -1.48
SOGA3-205ENST00000473298 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.79□□□□□ -1.48
SOGA3-205ENST00000473298 LINC00483Q53H64 154 aa5.78□□□□□ -1.48
SOGA3-205ENST00000473298 Q5VV11 94 aa5.78□□□□□ -1.48
SOGA3-205ENST00000473298 Q8N1X5 172 aa5.78□□□□□ -1.48
SOGA3-205ENST00000473298 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.75□□□□□ -1.49
SOGA3-205ENST00000473298 RYR2Q92736 4967 aa5.75□□□□□ -1.49
SOGA3-205ENST00000473298 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.74□□□□□ -1.49
SOGA3-205ENST00000473298 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.74□□□□□ -1.49
SOGA3-205ENST00000473298 Q1T7F1 81 aa5.73□□□□□ -1.49
SOGA3-205ENST00000473298 MYCBP2O75592 4640 aa5.73□□□□□ -1.49
SOGA3-205ENST00000473298 RYR3Q15413 4870 aa5.73□□□□□ -1.49
SOGA3-205ENST00000473298 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.73□□□□□ -1.49
SOGA3-205ENST00000473298 SPINK7P58062 85 aa5.73□□□□□ -1.49
SOGA3-205ENST00000473298 LCA10Q71F78 164 aa5.71□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 A0A1B0GVY2 172 aa5.71□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.71□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.71□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 HRES1P13985 223 aa5.7□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.7□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.69□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 A0A0A0MQY5 61 aa5.68□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 LIMD2Q9BT23 127 aa5.67□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 Q6ZSA8 131 aa5.66□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 PRAC1Q96KF2 57 aa5.66□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 PKD1P98161 4303 aa5.65□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.65□□□□□ -1.5
SOGA3-205ENST00000473298 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.63□□□□□ -1.51
SOGA3-205ENST00000473298 FAM229AH3BQW9 127 aa5.63□□□□□ -1.51
SOGA3-205ENST00000473298 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.63□□□□□ -1.51
SOGA3-205ENST00000473298 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.63□□□□□ -1.51
SOGA3-205ENST00000473298 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.62□□□□□ -1.51
SOGA3-205ENST00000473298 H3BPC8 53 aa5.61□□□□□ -1.51
SOGA3-205ENST00000473298 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.61□□□□□ -1.51
SOGA3-205ENST00000473298 LINC01554Q52M75 96 aa5.59□□□□□ -1.51
SOGA3-205ENST00000473298 Q5VSD8 79 aa5.59□□□□□ -1.51
SOGA3-205ENST00000473298 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.59□□□□□ -1.51
SOGA3-205ENST00000473298 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
SOGA3-205ENST00000473298 ACYP2P14621 99 aa5.58□□□□□ -1.52
SOGA3-205ENST00000473298 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SOGA3-205ENST00000473298 A0A1B0GU69 56 aa5.55□□□□□ -1.52
SOGA3-205ENST00000473298 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.53□□□□□ -1.52
SOGA3-205ENST00000473298 Q75L30 129 aa5.53□□□□□ -1.52
SOGA3-205ENST00000473298 A6NN06 94 aa5.52□□□□□ -1.53
SOGA3-205ENST00000473298 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.5□□□□□ -1.53
SOGA3-205ENST00000473298 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.5□□□□□ -1.53
SOGA3-205ENST00000473298 RYR1P21817 5038 aa5.5□□□□□ -1.53
SOGA3-205ENST00000473298 CRIPTQ9P021 101 aa5.49□□□□□ -1.53
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.49□□□□□ -1.53
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.46□□□□□ -1.54
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.46□□□□□ -1.54
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.44□□□□□ -1.54
SOGA3-205ENST00000473298 DMAC1Q96GE9 116 aa5.43□□□□□ -1.54
SOGA3-205ENST00000473298 HSPG2P98160 4391 aa5.42□□□□□ -1.54
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SOGA3-205ENST00000473298 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.41□□□□□ -1.54
SOGA3-205ENST00000473298 A0A0D9SG42 100 aa5.4□□□□□ -1.55
SOGA3-205ENST00000473298 J3QL48 77 aa5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.6 ms