RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473252.5

C9orf85-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 85, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf85, Length 678 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85-204ENST00000473252 CCKP06307 115 aa6.7□□□□□ -1.34
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C9orf85-204ENST00000473252 DSCR8Q96T75 97 aa6.68□□□□□ -1.34
C9orf85-204ENST00000473252 A8MUU9 505 aa6.67□□□□□ -1.34
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C9orf85-204ENST00000473252 IGKV4-1P06312 121 aa6.66□□□□□ -1.34
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C9orf85-204ENST00000473252 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.57□□□□□ -1.36
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C9orf85-204ENST00000473252 A0A1B0GVX0 72 aa6.55□□□□□ -1.36
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C9orf85-204ENST00000473252 K7EP34 96 aa6.29□□□□□ -1.4
C9orf85-204ENST00000473252 PRO0461Q9UI25 63 aa6.28□□□□□ -1.4
C9orf85-204ENST00000473252 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf85-204ENST00000473252 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf85-204ENST00000473252 UBL5Q9BZL1 73 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf85-204ENST00000473252 NDUFS5O43920 106 aa6.25□□□□□ -1.41
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C9orf85-204ENST00000473252 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf85-204ENST00000473252 Q8N9L7 120 aa6.18□□□□□ -1.42
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C9orf85-204ENST00000473252 IGKV2-30P06310 120 aa6.13□□□□□ -1.43
C9orf85-204ENST00000473252 KRTAP10-10P60014 251 aa6.12□□□□□ -1.43
C9orf85-204ENST00000473252 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.11□□□□□ -1.43
C9orf85-204ENST00000473252 ACYP1P07311 99 aa6.09□□□□□ -1.43
C9orf85-204ENST00000473252 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.04□□□□□ -1.44
C9orf85-204ENST00000473252 C4orf26Q17RF5 130 aa6.03□□□□□ -1.44
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C9orf85-204ENST00000473252 USH2AO75445 5202 aa5.96□□□□□ -1.46
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