RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-210ENST00000462363 KLKP1Q107X0 134 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-210ENST00000462363 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-210ENST00000462363 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A0U1RQV1 116 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-210ENST00000462363 HCG22E2RYF7 251 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-210ENST00000462363 C20orf197Q8N268 126 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-210ENST00000462363 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
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PTPRC-210ENST00000462363 Q5VSD8 79 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-210ENST00000462363 MYCBP2O75592 4640 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFS5O43920 106 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-210ENST00000462363 MT1HL1P0DM35 61 aa3.09□□□□□ -1.91
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