RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.12□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCGB1A1P11684 91 aa6.12□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.12□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.11□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.11□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 IMUPQ9GZP8 106 aa6.11□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 NREPQ16612 68 aa6.1□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.1□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.1□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6Q795 121 aa6.09□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGFL1Q6UW32 110 aa6.09□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.08□□□□□ -1.44
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZVQ6 151 aa6.08□□□□□ -1.44
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.07□□□□□ -1.44
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1W2PNM2 257 aa6.07□□□□□ -1.44
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.07□□□□□ -1.44
APOBEC3C-202ENST00000428892 CXCL6P80162 114 aa6.05□□□□□ -1.44
APOBEC3C-202ENST00000428892 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.04□□□□□ -1.44
APOBEC3C-202ENST00000428892 BPY2O14599 106 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC3C-202ENST00000428892 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
APOBEC3C-202ENST00000428892 CD164Q04900 197 aa6.03□□□□□ -1.44
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A087WSZ3 146 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.01□□□□□ -1.45
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0G2JQZ4 141 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q5XG85 94 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3C-202ENST00000428892 HRCT1Q6UXD1 115 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3C-202ENST00000428892 SS18L2Q9UHA2 77 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3C-202ENST00000428892 LIMD2Q9BT23 127 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.97□□□□□ -1.45
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.97□□□□□ -1.45
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q75L30 129 aa5.97□□□□□ -1.45
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.96□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 J3KT08 172 aa5.95□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A087WVE0 104 aa5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATOX1O00244 68 aa5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1orf195Q5TG92 126 aa5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 NDUFB1O75438 58 aa5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 M0R2T5 61 aa5.91□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 MT1HP80294 61 aa5.91□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.91□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGKV4-1P06312 121 aa5.9□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 DSCR10P59022 87 aa5.9□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.9□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.9□□□□□ -1.46
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCOTHQ58A44 107 aa5.89□□□□□ -1.47
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q8N9L7 120 aa5.89□□□□□ -1.47
APOBEC3C-202ENST00000428892 A8MWP4 228 aa5.88□□□□□ -1.47
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.87□□□□□ -1.47
APOBEC3C-202ENST00000428892 C9orf92A6NGG3 77 aa5.86□□□□□ -1.47
APOBEC3C-202ENST00000428892 K7EQZ3 153 aa5.86□□□□□ -1.47
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRR15Q8IV56 129 aa5.86□□□□□ -1.47
APOBEC3C-202ENST00000428892 HCG22E2RYF7 251 aa5.85□□□□□ -1.47
APOBEC3C-202ENST00000428892 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.85□□□□□ -1.47
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
APOBEC3C-202ENST00000428892 SERP2Q8N6R1 65 aa5.84□□□□□ -1.47
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.83□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.83□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q96NJ1 140 aa5.83□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.82□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.82□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 UQCRQO14949 82 aa5.82□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 COX7CP15954 63 aa5.82□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.82□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1B0GVX0 72 aa5.8□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 CASC2Q6XLA1 102 aa5.8□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.8□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.79□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.78□□□□□ -1.48
APOBEC3C-202ENST00000428892 hDV103S1A0JD37 113 aa5.77□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 C8orf87E5RJ46 101 aa5.77□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC179H3BU77 68 aa5.76□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 LCE4AQ5TA78 99 aa5.76□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 OCR1Q9BZK8 76 aa5.75□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.74□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00313P59037 77 aa5.73□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 C5orf47Q569G3 176 aa5.73□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.73□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.72□□□□□ -1.49
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 NDUFS5O43920 106 aa5.71□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 MP68P56378 58 aa5.71□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 C20orf197Q8N268 126 aa5.71□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 NDUFC1O43677 76 aa5.68□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.68□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 A8MUU9 505 aa5.67□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.67□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.66□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 H3BPC8 53 aa5.66□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLKP1Q107X0 134 aa5.66□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.66□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNURFQ9Y675 71 aa5.65□□□□□ -1.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 H0Y9P7 68 aa5.64□□□□□ -1.51
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