RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420309.5

PCBP1-AS1-216, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCBP1-AS1, Length 573 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SONP18583 2426 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZANQ9Y493 2812 aa3.29□□□□□ -1.88
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 LY6G6CO95867 125 aa3.28□□□□□ -1.88
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DEFB136Q30KP8 78 aa3.28□□□□□ -1.88
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.28□□□□□ -1.88
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.28□□□□□ -1.88
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.28□□□□□ -1.88
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 A0A096LPF7 62 aa3.26□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MTORP42345 2549 aa3.26□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 C2CD3Q4AC94 2353 aa3.25□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 H3BNG1 76 aa3.25□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.25□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.24□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 JMJD1CQ15652 2540 aa3.23□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.23□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.23□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.23□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.23□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.23□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 LCE3BQ5TA77 95 aa3.22□□□□□ -1.89
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.21□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.21□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.21□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.21□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 INE1O15225 51 aa3.2□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.2□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.19□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.19□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.18□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NF1P21359 2839 aa3.18□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 IGKV2-30P06310 120 aa3.18□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.18□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ATRQ13535 2644 aa3.18□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TPRXLQ17RH7 258 aa3.17□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CUBNO60494 3623 aa3.17□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PRLHP81277 87 aa3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 COL6A5A8TX70 2615 aa3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 H0YAA0 97 aa3.15□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.15□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.14□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PLAC4Q8WY50 150 aa3.14□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP10-3P60369 221 aa3.13□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.13□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 STAB1Q9NY15 2570 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 HTN3P15516 51 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 Q6ZSA8 131 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.1□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.1□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 K7EIL1 84 aa3.09□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DEFB135Q30KP9 77 aa3.09□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ANK2Q01484 3957 aa3.09□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 C14orf177Q52M58 125 aa3.08□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.08□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CRIPTQ9P021 101 aa3.08□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.06□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.06□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 A0A096LNI7 61 aa3.05□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.04□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DEFB4AO15263 64 aa3.04□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.03□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.03□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MGAM2Q2M2H8 2515 aa3.03□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 VWFP04275 2813 aa3.02□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DNHD1Q96M86 4753 aa3.02□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP10-11P60412 298 aa3.02□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NOTCH1P46531 2555 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SPINK1P00995 79 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 LCE1DQ5T752 114 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SPINK6Q6UWN8 80 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP10-2P60368 255 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.98□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PP632Q6XCG6 107 aa2.97□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 FBN3Q75N90 2809 aa2.97□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.96□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP12-2P59991 146 aa2.96□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.96□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa2.94□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.93□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.93□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TENM2Q9NT68 2774 aa2.93□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DNAH9Q9NYC9 4486 aa2.92□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.94
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TGP01266 2768 aa2.89□□□□□ -1.95
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.89□□□□□ -1.95
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 COL7A1Q02388 2944 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms