RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GW54 56 aa3.99□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 F8WEM9 126 aa3.99□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 SPRR1BP22528 89 aa3.99□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 Q6Q795 121 aa3.99□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.99□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.99□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 Q8N377 158 aa3.99□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.98□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GV72 72 aa3.98□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 MT-ATP8P03928 68 aa3.98□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 Q6JHZ5 121 aa3.98□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZSA8 131 aa3.98□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.98□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 UBL5Q9BZL1 73 aa3.98□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 IMUPQ9GZP8 106 aa3.98□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.98□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 ERC2-IT1O76042 136 aa3.97□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.97□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.97□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 LINC00846Q9NV44 126 aa3.97□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CCL20-202ENST00000409189 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.96□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 A0A087X002 238 aa3.96□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.96□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 DPH3Q96FX2 82 aa3.96□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 PRAC1Q96KF2 57 aa3.96□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 C1orf137Q5JT78 98 aa3.95□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 Q8NBF4 154 aa3.95□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 LINC00483Q53H64 154 aa3.94□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 SCXQ7RTU7 201 aa3.94□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.94□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 ZNF861PO60384 105 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 CXCL6P80162 114 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZVQ6 151 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 SPRR4Q96PI1 79 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.92□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PNM2 257 aa3.91□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 IGLV7-43P04211 117 aa3.91□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 CRYGAP11844 174 aa3.91□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 IGFL1Q6UW32 110 aa3.91□□□□□ -1.78
CCL20-202ENST00000409189 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.89□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.89□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.89□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 NREPQ16612 68 aa3.88□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 ATOX1O00244 68 aa3.87□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.87□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.86□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 BPY2O14599 106 aa3.86□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.86□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.86□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.86□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 A0A087WSZ3 146 aa3.85□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 A0A087WVE0 104 aa3.84□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 MOBPQ13875 183 aa3.84□□□□□ -1.79
CCL20-202ENST00000409189 J3KT08 172 aa3.83□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 IGKV4-1P06312 121 aa3.83□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 CD164Q04900 197 aa3.83□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.83□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP5-8O75690 187 aa3.82□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.81□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.81□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 A0A0G2JQZ4 141 aa3.8□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 A0A0U1RQV1 116 aa3.8□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.8□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 DSCR10P59022 87 aa3.8□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 LCE3AQ5TA76 89 aa3.8□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.8□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 A8MWP4 228 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 K7EQZ3 153 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 UQCRQO14949 82 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 COX7CP15954 63 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 SERP2Q8N6R1 65 aa3.79□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 HCG22E2RYF7 251 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 Q5XG85 94 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 Q8N9L7 120 aa3.78□□□□□ -1.8
CCL20-202ENST00000409189 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.77□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 PRR15Q8IV56 129 aa3.77□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 Q96NJ1 140 aa3.77□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 LIMD2Q9BT23 127 aa3.77□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.77□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 NDUFB1O75438 58 aa3.76□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP10-8P60410 259 aa3.76□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.76□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.76□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 CCDC179H3BU77 68 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 OCR1Q9BZK8 76 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.73□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GVX0 72 aa3.73□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 NDUFAF8A1L188 74 aa3.73□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.73□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.73□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 SPINK1P00995 79 aa3.72□□□□□ -1.81
CCL20-202ENST00000409189 KLKP1Q107X0 134 aa3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.3 ms